Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SH3BP4Q9P0V3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SH3BP4Q9P0V3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SH3BP4Q9P0V3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SH3BP4Q9P0V3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SH3BP4Q9P0V3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SH3BP4Q9P0V3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SH3BP4Q9P0V3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SH3BP4Q9P0V3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SH3BP4Q9P0V3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SH3BP4Q9P0V3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SH3BP4Q9P0V3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SH3BP4Q9P0V3 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SH3BP4Q9P0V3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SH3BP4Q9P0V3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SH3BP4Q9P0V3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SH3BP4Q9P0V3 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SH3BP4Q9P0V3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SH3BP4Q9P0V3 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SH3BP4Q9P0V3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SH3BP4Q9P0V3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SH3BP4Q9P0V3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SH3BP4Q9P0V3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SH3BP4Q9P0V3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SH3BP4Q9P0V3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SH3BP4Q9P0V3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SH3BP4Q9P0V3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SH3BP4Q9P0V3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SH3BP4Q9P0V3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SH3BP4Q9P0V3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SH3BP4Q9P0V3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SH3BP4Q9P0V3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SH3BP4Q9P0V3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SH3BP4Q9P0V3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SH3BP4Q9P0V3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SH3BP4Q9P0V3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SH3BP4Q9P0V3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SH3BP4Q9P0V3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SH3BP4Q9P0V3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
SH3BP4Q9P0V3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SH3BP4Q9P0V3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SH3BP4Q9P0V3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SH3BP4Q9P0V3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SH3BP4Q9P0V3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SH3BP4Q9P0V3 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SH3BP4Q9P0V3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SH3BP4Q9P0V3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SH3BP4Q9P0V3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SH3BP4Q9P0V3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SH3BP4Q9P0V3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SH3BP4Q9P0V3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SH3BP4Q9P0V3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SH3BP4Q9P0V3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SH3BP4Q9P0V3 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SH3BP4Q9P0V3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SH3BP4Q9P0V3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SH3BP4Q9P0V3 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SH3BP4Q9P0V3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SH3BP4Q9P0V3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SH3BP4Q9P0V3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SH3BP4Q9P0V3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SH3BP4Q9P0V3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SH3BP4Q9P0V3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SH3BP4Q9P0V3 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SH3BP4Q9P0V3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SH3BP4Q9P0V3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SH3BP4Q9P0V3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SH3BP4Q9P0V3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SH3BP4Q9P0V3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SH3BP4Q9P0V3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SH3BP4Q9P0V3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SH3BP4Q9P0V3 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SH3BP4Q9P0V3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SH3BP4Q9P0V3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SH3BP4Q9P0V3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SH3BP4Q9P0V3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SH3BP4Q9P0V3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SH3BP4Q9P0V3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SH3BP4Q9P0V3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SH3BP4Q9P0V3 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SH3BP4Q9P0V3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SH3BP4Q9P0V3 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SH3BP4Q9P0V3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SH3BP4Q9P0V3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SH3BP4Q9P0V3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SH3BP4Q9P0V3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SH3BP4Q9P0V3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SH3BP4Q9P0V3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SH3BP4Q9P0V3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SH3BP4Q9P0V3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SH3BP4Q9P0V3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SH3BP4Q9P0V3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SH3BP4Q9P0V3 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SH3BP4Q9P0V3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SH3BP4Q9P0V3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SH3BP4Q9P0V3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SH3BP4Q9P0V3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SH3BP4Q9P0V3 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SH3BP4Q9P0V3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SH3BP4Q9P0V3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
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