Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZM1

MYOF, Myoferlin, humanhuman

Predictions only

Length 2,061 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYOFQ9NZM1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
MYOFQ9NZM1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MYOFQ9NZM1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MYOFQ9NZM1 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MYOFQ9NZM1 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MYOFQ9NZM1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MYOFQ9NZM1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MYOFQ9NZM1 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MYOFQ9NZM1 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MYOFQ9NZM1 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MYOFQ9NZM1 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MYOFQ9NZM1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MYOFQ9NZM1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MYOFQ9NZM1 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MYOFQ9NZM1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MYOFQ9NZM1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MYOFQ9NZM1 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MYOFQ9NZM1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MYOFQ9NZM1 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MYOFQ9NZM1 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MYOFQ9NZM1 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MYOFQ9NZM1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MYOFQ9NZM1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MYOFQ9NZM1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MYOFQ9NZM1 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MYOFQ9NZM1 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MYOFQ9NZM1 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MYOFQ9NZM1 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MYOFQ9NZM1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MYOFQ9NZM1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MYOFQ9NZM1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MYOFQ9NZM1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MYOFQ9NZM1 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MYOFQ9NZM1 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MYOFQ9NZM1 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MYOFQ9NZM1 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MYOFQ9NZM1 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MYOFQ9NZM1 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MYOFQ9NZM1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MYOFQ9NZM1 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
MYOFQ9NZM1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MYOFQ9NZM1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MYOFQ9NZM1 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MYOFQ9NZM1 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MYOFQ9NZM1 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
MYOFQ9NZM1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MYOFQ9NZM1 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MYOFQ9NZM1 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MYOFQ9NZM1 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
MYOFQ9NZM1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MYOFQ9NZM1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MYOFQ9NZM1 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MYOFQ9NZM1 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MYOFQ9NZM1 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MYOFQ9NZM1 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
MYOFQ9NZM1 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
MYOFQ9NZM1 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
MYOFQ9NZM1 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
MYOFQ9NZM1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MYOFQ9NZM1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MYOFQ9NZM1 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MYOFQ9NZM1 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
MYOFQ9NZM1 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MYOFQ9NZM1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MYOFQ9NZM1 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MYOFQ9NZM1 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MYOFQ9NZM1 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
MYOFQ9NZM1 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MYOFQ9NZM1 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MYOFQ9NZM1 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
MYOFQ9NZM1 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MYOFQ9NZM1 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MYOFQ9NZM1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MYOFQ9NZM1 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MYOFQ9NZM1 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
MYOFQ9NZM1 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MYOFQ9NZM1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MYOFQ9NZM1 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MYOFQ9NZM1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MYOFQ9NZM1 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MYOFQ9NZM1 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MYOFQ9NZM1 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MYOFQ9NZM1 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
MYOFQ9NZM1 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MYOFQ9NZM1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MYOFQ9NZM1 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MYOFQ9NZM1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MYOFQ9NZM1 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
MYOFQ9NZM1 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MYOFQ9NZM1 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MYOFQ9NZM1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MYOFQ9NZM1 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MYOFQ9NZM1 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
MYOFQ9NZM1 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
MYOFQ9NZM1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MYOFQ9NZM1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MYOFQ9NZM1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MYOFQ9NZM1 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MYOFQ9NZM1 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MYOFQ9NZM1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms