Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ94

NLGN3, Neuroligin-3, humanhuman

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLGN3Q9NZ94 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NLGN3Q9NZ94 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NLGN3Q9NZ94 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NLGN3Q9NZ94 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NLGN3Q9NZ94 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NLGN3Q9NZ94 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NLGN3Q9NZ94 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NLGN3Q9NZ94 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NLGN3Q9NZ94 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NLGN3Q9NZ94 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NLGN3Q9NZ94 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NLGN3Q9NZ94 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NLGN3Q9NZ94 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NLGN3Q9NZ94 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NLGN3Q9NZ94 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NLGN3Q9NZ94 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
NLGN3Q9NZ94 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NLGN3Q9NZ94 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NLGN3Q9NZ94 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NLGN3Q9NZ94 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NLGN3Q9NZ94 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NLGN3Q9NZ94 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NLGN3Q9NZ94 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NLGN3Q9NZ94 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NLGN3Q9NZ94 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NLGN3Q9NZ94 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NLGN3Q9NZ94 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NLGN3Q9NZ94 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NLGN3Q9NZ94 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NLGN3Q9NZ94 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NLGN3Q9NZ94 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NLGN3Q9NZ94 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NLGN3Q9NZ94 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NLGN3Q9NZ94 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NLGN3Q9NZ94 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23■■□□□ 1.27
NLGN3Q9NZ94 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NLGN3Q9NZ94 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NLGN3Q9NZ94 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23■■□□□ 1.27
NLGN3Q9NZ94 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NLGN3Q9NZ94 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NLGN3Q9NZ94 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NLGN3Q9NZ94 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NLGN3Q9NZ94 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NLGN3Q9NZ94 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NLGN3Q9NZ94 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NLGN3Q9NZ94 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NLGN3Q9NZ94 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NLGN3Q9NZ94 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NLGN3Q9NZ94 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NLGN3Q9NZ94 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NLGN3Q9NZ94 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NLGN3Q9NZ94 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NLGN3Q9NZ94 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NLGN3Q9NZ94 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NLGN3Q9NZ94 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NLGN3Q9NZ94 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NLGN3Q9NZ94 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NLGN3Q9NZ94 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NLGN3Q9NZ94 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NLGN3Q9NZ94 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NLGN3Q9NZ94 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NLGN3Q9NZ94 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NLGN3Q9NZ94 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NLGN3Q9NZ94 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NLGN3Q9NZ94 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NLGN3Q9NZ94 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NLGN3Q9NZ94 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NLGN3Q9NZ94 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NLGN3Q9NZ94 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NLGN3Q9NZ94 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NLGN3Q9NZ94 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NLGN3Q9NZ94 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
NLGN3Q9NZ94 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NLGN3Q9NZ94 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NLGN3Q9NZ94 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NLGN3Q9NZ94 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NLGN3Q9NZ94 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NLGN3Q9NZ94 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NLGN3Q9NZ94 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NLGN3Q9NZ94 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NLGN3Q9NZ94 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NLGN3Q9NZ94 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NLGN3Q9NZ94 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NLGN3Q9NZ94 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NLGN3Q9NZ94 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NLGN3Q9NZ94 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NLGN3Q9NZ94 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NLGN3Q9NZ94 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NLGN3Q9NZ94 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NLGN3Q9NZ94 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NLGN3Q9NZ94 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NLGN3Q9NZ94 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NLGN3Q9NZ94 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NLGN3Q9NZ94 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NLGN3Q9NZ94 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NLGN3Q9NZ94 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NLGN3Q9NZ94 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NLGN3Q9NZ94 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NLGN3Q9NZ94 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NLGN3Q9NZ94 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms