Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYK5

MRPL39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL39Q9NYK5 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MRPL39Q9NYK5 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MRPL39Q9NYK5 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MRPL39Q9NYK5 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MRPL39Q9NYK5 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MRPL39Q9NYK5 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MRPL39Q9NYK5 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MRPL39Q9NYK5 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MRPL39Q9NYK5 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MRPL39Q9NYK5 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
MRPL39Q9NYK5 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MRPL39Q9NYK5 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MRPL39Q9NYK5 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MRPL39Q9NYK5 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.32■■□□□ 1
MRPL39Q9NYK5 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
MRPL39Q9NYK5 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MRPL39Q9NYK5 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MRPL39Q9NYK5 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MRPL39Q9NYK5 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MRPL39Q9NYK5 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MRPL39Q9NYK5 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MRPL39Q9NYK5 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MRPL39Q9NYK5 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MRPL39Q9NYK5 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MRPL39Q9NYK5 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MRPL39Q9NYK5 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MRPL39Q9NYK5 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MRPL39Q9NYK5 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MRPL39Q9NYK5 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MRPL39Q9NYK5 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MRPL39Q9NYK5 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MRPL39Q9NYK5 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MRPL39Q9NYK5 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MRPL39Q9NYK5 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MRPL39Q9NYK5 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MRPL39Q9NYK5 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MRPL39Q9NYK5 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MRPL39Q9NYK5 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MRPL39Q9NYK5 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MRPL39Q9NYK5 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MRPL39Q9NYK5 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MRPL39Q9NYK5 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MRPL39Q9NYK5 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MRPL39Q9NYK5 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MRPL39Q9NYK5 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MRPL39Q9NYK5 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.29■■□□□ 1
MRPL39Q9NYK5 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MRPL39Q9NYK5 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MRPL39Q9NYK5 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MRPL39Q9NYK5 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.29■■□□□ 1
MRPL39Q9NYK5 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MRPL39Q9NYK5 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MRPL39Q9NYK5 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MRPL39Q9NYK5 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MRPL39Q9NYK5 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MRPL39Q9NYK5 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MRPL39Q9NYK5 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MRPL39Q9NYK5 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MRPL39Q9NYK5 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MRPL39Q9NYK5 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MRPL39Q9NYK5 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MRPL39Q9NYK5 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MRPL39Q9NYK5 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MRPL39Q9NYK5 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MRPL39Q9NYK5 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MRPL39Q9NYK5 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MRPL39Q9NYK5 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MRPL39Q9NYK5 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MRPL39Q9NYK5 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MRPL39Q9NYK5 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MRPL39Q9NYK5 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MRPL39Q9NYK5 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MRPL39Q9NYK5 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MRPL39Q9NYK5 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MRPL39Q9NYK5 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MRPL39Q9NYK5 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MRPL39Q9NYK5 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MRPL39Q9NYK5 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MRPL39Q9NYK5 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MRPL39Q9NYK5 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
MRPL39Q9NYK5 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
MRPL39Q9NYK5 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MRPL39Q9NYK5 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MRPL39Q9NYK5 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MRPL39Q9NYK5 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MRPL39Q9NYK5 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MRPL39Q9NYK5 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MRPL39Q9NYK5 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MRPL39Q9NYK5 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MRPL39Q9NYK5 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MRPL39Q9NYK5 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MRPL39Q9NYK5 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MRPL39Q9NYK5 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MRPL39Q9NYK5 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MRPL39Q9NYK5 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
MRPL39Q9NYK5 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MRPL39Q9NYK5 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MRPL39Q9NYK5 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MRPL39Q9NYK5 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MRPL39Q9NYK5 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 177.4 ms