Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY59

SMPD3, Sphingomyelin phosphodiesterase 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD3Q9NY59 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMPD3Q9NY59 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMPD3Q9NY59 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMPD3Q9NY59 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMPD3Q9NY59 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMPD3Q9NY59 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMPD3Q9NY59 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMPD3Q9NY59 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMPD3Q9NY59 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMPD3Q9NY59 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMPD3Q9NY59 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMPD3Q9NY59 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMPD3Q9NY59 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMPD3Q9NY59 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMPD3Q9NY59 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMPD3Q9NY59 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMPD3Q9NY59 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMPD3Q9NY59 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMPD3Q9NY59 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMPD3Q9NY59 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMPD3Q9NY59 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMPD3Q9NY59 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMPD3Q9NY59 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMPD3Q9NY59 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMPD3Q9NY59 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMPD3Q9NY59 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMPD3Q9NY59 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMPD3Q9NY59 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SMPD3Q9NY59 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMPD3Q9NY59 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMPD3Q9NY59 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMPD3Q9NY59 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMPD3Q9NY59 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMPD3Q9NY59 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMPD3Q9NY59 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMPD3Q9NY59 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMPD3Q9NY59 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMPD3Q9NY59 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMPD3Q9NY59 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMPD3Q9NY59 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMPD3Q9NY59 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMPD3Q9NY59 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMPD3Q9NY59 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMPD3Q9NY59 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMPD3Q9NY59 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SMPD3Q9NY59 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMPD3Q9NY59 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SMPD3Q9NY59 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SMPD3Q9NY59 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SMPD3Q9NY59 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
SMPD3Q9NY59 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SMPD3Q9NY59 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMPD3Q9NY59 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMPD3Q9NY59 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMPD3Q9NY59 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMPD3Q9NY59 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMPD3Q9NY59 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMPD3Q9NY59 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMPD3Q9NY59 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMPD3Q9NY59 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMPD3Q9NY59 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMPD3Q9NY59 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SMPD3Q9NY59 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMPD3Q9NY59 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SMPD3Q9NY59 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMPD3Q9NY59 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SMPD3Q9NY59 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMPD3Q9NY59 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMPD3Q9NY59 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMPD3Q9NY59 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMPD3Q9NY59 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMPD3Q9NY59 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMPD3Q9NY59 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMPD3Q9NY59 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMPD3Q9NY59 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMPD3Q9NY59 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMPD3Q9NY59 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMPD3Q9NY59 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMPD3Q9NY59 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMPD3Q9NY59 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMPD3Q9NY59 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMPD3Q9NY59 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMPD3Q9NY59 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMPD3Q9NY59 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMPD3Q9NY59 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMPD3Q9NY59 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMPD3Q9NY59 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMPD3Q9NY59 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMPD3Q9NY59 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMPD3Q9NY59 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMPD3Q9NY59 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMPD3Q9NY59 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMPD3Q9NY59 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMPD3Q9NY59 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMPD3Q9NY59 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMPD3Q9NY59 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMPD3Q9NY59 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMPD3Q9NY59 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMPD3Q9NY59 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMPD3Q9NY59 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 896 ms