Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXZ2

DDX43, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX43Q9NXZ2 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DDX43Q9NXZ2 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DDX43Q9NXZ2 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
DDX43Q9NXZ2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DDX43Q9NXZ2 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DDX43Q9NXZ2 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
DDX43Q9NXZ2 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
DDX43Q9NXZ2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
DDX43Q9NXZ2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DDX43Q9NXZ2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DDX43Q9NXZ2 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
DDX43Q9NXZ2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DDX43Q9NXZ2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DDX43Q9NXZ2 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DDX43Q9NXZ2 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DDX43Q9NXZ2 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DDX43Q9NXZ2 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DDX43Q9NXZ2 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DDX43Q9NXZ2 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DDX43Q9NXZ2 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DDX43Q9NXZ2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DDX43Q9NXZ2 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DDX43Q9NXZ2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DDX43Q9NXZ2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DDX43Q9NXZ2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DDX43Q9NXZ2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DDX43Q9NXZ2 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
DDX43Q9NXZ2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DDX43Q9NXZ2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DDX43Q9NXZ2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DDX43Q9NXZ2 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DDX43Q9NXZ2 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DDX43Q9NXZ2 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DDX43Q9NXZ2 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DDX43Q9NXZ2 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DDX43Q9NXZ2 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
DDX43Q9NXZ2 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DDX43Q9NXZ2 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DDX43Q9NXZ2 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DDX43Q9NXZ2 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
DDX43Q9NXZ2 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DDX43Q9NXZ2 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
DDX43Q9NXZ2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DDX43Q9NXZ2 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
DDX43Q9NXZ2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
DDX43Q9NXZ2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
DDX43Q9NXZ2 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DDX43Q9NXZ2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DDX43Q9NXZ2 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
DDX43Q9NXZ2 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DDX43Q9NXZ2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DDX43Q9NXZ2 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DDX43Q9NXZ2 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
DDX43Q9NXZ2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DDX43Q9NXZ2 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DDX43Q9NXZ2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DDX43Q9NXZ2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
DDX43Q9NXZ2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DDX43Q9NXZ2 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
DDX43Q9NXZ2 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
DDX43Q9NXZ2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
DDX43Q9NXZ2 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
DDX43Q9NXZ2 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DDX43Q9NXZ2 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
DDX43Q9NXZ2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DDX43Q9NXZ2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DDX43Q9NXZ2 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DDX43Q9NXZ2 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
DDX43Q9NXZ2 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DDX43Q9NXZ2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DDX43Q9NXZ2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DDX43Q9NXZ2 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DDX43Q9NXZ2 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DDX43Q9NXZ2 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DDX43Q9NXZ2 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DDX43Q9NXZ2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DDX43Q9NXZ2 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DDX43Q9NXZ2 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DDX43Q9NXZ2 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DDX43Q9NXZ2 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DDX43Q9NXZ2 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
DDX43Q9NXZ2 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DDX43Q9NXZ2 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DDX43Q9NXZ2 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DDX43Q9NXZ2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DDX43Q9NXZ2 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DDX43Q9NXZ2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DDX43Q9NXZ2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DDX43Q9NXZ2 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
DDX43Q9NXZ2 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
DDX43Q9NXZ2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DDX43Q9NXZ2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DDX43Q9NXZ2 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DDX43Q9NXZ2 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DDX43Q9NXZ2 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DDX43Q9NXZ2 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DDX43Q9NXZ2 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DDX43Q9NXZ2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DDX43Q9NXZ2 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DDX43Q9NXZ2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.6 ms