Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW6

NMRK1, Nicotinamide riboside kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMRK1Q9NWW6 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NMRK1Q9NWW6 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NMRK1Q9NWW6 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
NMRK1Q9NWW6 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NMRK1Q9NWW6 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NMRK1Q9NWW6 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
NMRK1Q9NWW6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NMRK1Q9NWW6 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NMRK1Q9NWW6 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NMRK1Q9NWW6 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NMRK1Q9NWW6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NMRK1Q9NWW6 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NMRK1Q9NWW6 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NMRK1Q9NWW6 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NMRK1Q9NWW6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NMRK1Q9NWW6 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NMRK1Q9NWW6 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NMRK1Q9NWW6 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NMRK1Q9NWW6 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NMRK1Q9NWW6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NMRK1Q9NWW6 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NMRK1Q9NWW6 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NMRK1Q9NWW6 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NMRK1Q9NWW6 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NMRK1Q9NWW6 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NMRK1Q9NWW6 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NMRK1Q9NWW6 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NMRK1Q9NWW6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NMRK1Q9NWW6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NMRK1Q9NWW6 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NMRK1Q9NWW6 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NMRK1Q9NWW6 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NMRK1Q9NWW6 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NMRK1Q9NWW6 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NMRK1Q9NWW6 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NMRK1Q9NWW6 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NMRK1Q9NWW6 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NMRK1Q9NWW6 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NMRK1Q9NWW6 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NMRK1Q9NWW6 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NMRK1Q9NWW6 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NMRK1Q9NWW6 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NMRK1Q9NWW6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NMRK1Q9NWW6 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NMRK1Q9NWW6 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NMRK1Q9NWW6 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NMRK1Q9NWW6 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NMRK1Q9NWW6 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NMRK1Q9NWW6 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NMRK1Q9NWW6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NMRK1Q9NWW6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NMRK1Q9NWW6 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NMRK1Q9NWW6 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NMRK1Q9NWW6 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NMRK1Q9NWW6 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NMRK1Q9NWW6 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NMRK1Q9NWW6 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NMRK1Q9NWW6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NMRK1Q9NWW6 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NMRK1Q9NWW6 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NMRK1Q9NWW6 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NMRK1Q9NWW6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NMRK1Q9NWW6 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NMRK1Q9NWW6 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NMRK1Q9NWW6 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NMRK1Q9NWW6 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NMRK1Q9NWW6 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NMRK1Q9NWW6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NMRK1Q9NWW6 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NMRK1Q9NWW6 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NMRK1Q9NWW6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NMRK1Q9NWW6 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NMRK1Q9NWW6 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NMRK1Q9NWW6 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NMRK1Q9NWW6 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NMRK1Q9NWW6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NMRK1Q9NWW6 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NMRK1Q9NWW6 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NMRK1Q9NWW6 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NMRK1Q9NWW6 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NMRK1Q9NWW6 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NMRK1Q9NWW6 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NMRK1Q9NWW6 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NMRK1Q9NWW6 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NMRK1Q9NWW6 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NMRK1Q9NWW6 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NMRK1Q9NWW6 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NMRK1Q9NWW6 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NMRK1Q9NWW6 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NMRK1Q9NWW6 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NMRK1Q9NWW6 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NMRK1Q9NWW6 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NMRK1Q9NWW6 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NMRK1Q9NWW6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NMRK1Q9NWW6 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NMRK1Q9NWW6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NMRK1Q9NWW6 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NMRK1Q9NWW6 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NMRK1Q9NWW6 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NMRK1Q9NWW6 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms