Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUS5

AP5S1, AP-5 complex subunit sigma-1, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP5S1Q9NUS5 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
AP5S1Q9NUS5 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
AP5S1Q9NUS5 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AP5S1Q9NUS5 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AP5S1Q9NUS5 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AP5S1Q9NUS5 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
AP5S1Q9NUS5 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AP5S1Q9NUS5 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AP5S1Q9NUS5 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AP5S1Q9NUS5 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AP5S1Q9NUS5 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AP5S1Q9NUS5 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AP5S1Q9NUS5 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AP5S1Q9NUS5 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AP5S1Q9NUS5 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AP5S1Q9NUS5 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
AP5S1Q9NUS5 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
AP5S1Q9NUS5 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
AP5S1Q9NUS5 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
AP5S1Q9NUS5 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
AP5S1Q9NUS5 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
AP5S1Q9NUS5 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
AP5S1Q9NUS5 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
AP5S1Q9NUS5 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
AP5S1Q9NUS5 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
AP5S1Q9NUS5 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
AP5S1Q9NUS5 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
AP5S1Q9NUS5 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AP5S1Q9NUS5 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AP5S1Q9NUS5 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AP5S1Q9NUS5 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
AP5S1Q9NUS5 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
AP5S1Q9NUS5 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AP5S1Q9NUS5 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
AP5S1Q9NUS5 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
AP5S1Q9NUS5 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
AP5S1Q9NUS5 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
AP5S1Q9NUS5 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AP5S1Q9NUS5 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AP5S1Q9NUS5 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AP5S1Q9NUS5 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AP5S1Q9NUS5 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AP5S1Q9NUS5 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AP5S1Q9NUS5 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AP5S1Q9NUS5 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AP5S1Q9NUS5 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AP5S1Q9NUS5 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AP5S1Q9NUS5 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AP5S1Q9NUS5 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AP5S1Q9NUS5 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AP5S1Q9NUS5 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AP5S1Q9NUS5 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AP5S1Q9NUS5 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AP5S1Q9NUS5 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AP5S1Q9NUS5 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AP5S1Q9NUS5 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AP5S1Q9NUS5 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AP5S1Q9NUS5 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AP5S1Q9NUS5 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AP5S1Q9NUS5 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AP5S1Q9NUS5 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AP5S1Q9NUS5 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AP5S1Q9NUS5 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AP5S1Q9NUS5 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP5S1Q9NUS5 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP5S1Q9NUS5 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP5S1Q9NUS5 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP5S1Q9NUS5 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP5S1Q9NUS5 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP5S1Q9NUS5 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP5S1Q9NUS5 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP5S1Q9NUS5 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP5S1Q9NUS5 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP5S1Q9NUS5 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
AP5S1Q9NUS5 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
AP5S1Q9NUS5 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP5S1Q9NUS5 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP5S1Q9NUS5 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
AP5S1Q9NUS5 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP5S1Q9NUS5 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP5S1Q9NUS5 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP5S1Q9NUS5 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP5S1Q9NUS5 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP5S1Q9NUS5 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP5S1Q9NUS5 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP5S1Q9NUS5 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP5S1Q9NUS5 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP5S1Q9NUS5 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP5S1Q9NUS5 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP5S1Q9NUS5 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP5S1Q9NUS5 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP5S1Q9NUS5 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP5S1Q9NUS5 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
AP5S1Q9NUS5 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AP5S1Q9NUS5 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
AP5S1Q9NUS5 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AP5S1Q9NUS5 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
AP5S1Q9NUS5 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
AP5S1Q9NUS5 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AP5S1Q9NUS5 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms