Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD5

SLC6A13, Sodium- and chloride-dependent GABA transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A13Q9NSD5 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC6A13Q9NSD5 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC6A13Q9NSD5 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC6A13Q9NSD5 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC6A13Q9NSD5 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC6A13Q9NSD5 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC6A13Q9NSD5 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC6A13Q9NSD5 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC6A13Q9NSD5 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC6A13Q9NSD5 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC6A13Q9NSD5 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC6A13Q9NSD5 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC6A13Q9NSD5 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC6A13Q9NSD5 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC6A13Q9NSD5 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC6A13Q9NSD5 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC6A13Q9NSD5 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC6A13Q9NSD5 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC6A13Q9NSD5 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC6A13Q9NSD5 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC6A13Q9NSD5 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC6A13Q9NSD5 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC6A13Q9NSD5 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC6A13Q9NSD5 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC6A13Q9NSD5 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC6A13Q9NSD5 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC6A13Q9NSD5 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC6A13Q9NSD5 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC6A13Q9NSD5 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC6A13Q9NSD5 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC6A13Q9NSD5 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC6A13Q9NSD5 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC6A13Q9NSD5 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC6A13Q9NSD5 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC6A13Q9NSD5 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC6A13Q9NSD5 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC6A13Q9NSD5 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC6A13Q9NSD5 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC6A13Q9NSD5 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC6A13Q9NSD5 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC6A13Q9NSD5 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC6A13Q9NSD5 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC6A13Q9NSD5 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC6A13Q9NSD5 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC6A13Q9NSD5 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC6A13Q9NSD5 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC6A13Q9NSD5 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC6A13Q9NSD5 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC6A13Q9NSD5 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC6A13Q9NSD5 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC6A13Q9NSD5 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC6A13Q9NSD5 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC6A13Q9NSD5 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC6A13Q9NSD5 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC6A13Q9NSD5 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC6A13Q9NSD5 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC6A13Q9NSD5 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC6A13Q9NSD5 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC6A13Q9NSD5 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC6A13Q9NSD5 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC6A13Q9NSD5 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC6A13Q9NSD5 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC6A13Q9NSD5 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC6A13Q9NSD5 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC6A13Q9NSD5 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC6A13Q9NSD5 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC6A13Q9NSD5 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC6A13Q9NSD5 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC6A13Q9NSD5 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC6A13Q9NSD5 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC6A13Q9NSD5 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC6A13Q9NSD5 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC6A13Q9NSD5 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC6A13Q9NSD5 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC6A13Q9NSD5 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC6A13Q9NSD5 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC6A13Q9NSD5 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC6A13Q9NSD5 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC6A13Q9NSD5 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC6A13Q9NSD5 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC6A13Q9NSD5 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC6A13Q9NSD5 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC6A13Q9NSD5 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC6A13Q9NSD5 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC6A13Q9NSD5 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC6A13Q9NSD5 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC6A13Q9NSD5 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC6A13Q9NSD5 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC6A13Q9NSD5 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC6A13Q9NSD5 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC6A13Q9NSD5 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC6A13Q9NSD5 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC6A13Q9NSD5 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC6A13Q9NSD5 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC6A13Q9NSD5 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC6A13Q9NSD5 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC6A13Q9NSD5 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC6A13Q9NSD5 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC6A13Q9NSD5 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC6A13Q9NSD5 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.7 ms