Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS93

TM7SF3, Transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3Q9NS93 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TM7SF3Q9NS93 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TM7SF3Q9NS93 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TM7SF3Q9NS93 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TM7SF3Q9NS93 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TM7SF3Q9NS93 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TM7SF3Q9NS93 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TM7SF3Q9NS93 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TM7SF3Q9NS93 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TM7SF3Q9NS93 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TM7SF3Q9NS93 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TM7SF3Q9NS93 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TM7SF3Q9NS93 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TM7SF3Q9NS93 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TM7SF3Q9NS93 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TM7SF3Q9NS93 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TM7SF3Q9NS93 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TM7SF3Q9NS93 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TM7SF3Q9NS93 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TM7SF3Q9NS93 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TM7SF3Q9NS93 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TM7SF3Q9NS93 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TM7SF3Q9NS93 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TM7SF3Q9NS93 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TM7SF3Q9NS93 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TM7SF3Q9NS93 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TM7SF3Q9NS93 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TM7SF3Q9NS93 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TM7SF3Q9NS93 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TM7SF3Q9NS93 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TM7SF3Q9NS93 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TM7SF3Q9NS93 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TM7SF3Q9NS93 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TM7SF3Q9NS93 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TM7SF3Q9NS93 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TM7SF3Q9NS93 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TM7SF3Q9NS93 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TM7SF3Q9NS93 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TM7SF3Q9NS93 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TM7SF3Q9NS93 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TM7SF3Q9NS93 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TM7SF3Q9NS93 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TM7SF3Q9NS93 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TM7SF3Q9NS93 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TM7SF3Q9NS93 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TM7SF3Q9NS93 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TM7SF3Q9NS93 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TM7SF3Q9NS93 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TM7SF3Q9NS93 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TM7SF3Q9NS93 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TM7SF3Q9NS93 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TM7SF3Q9NS93 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TM7SF3Q9NS93 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TM7SF3Q9NS93 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TM7SF3Q9NS93 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TM7SF3Q9NS93 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TM7SF3Q9NS93 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TM7SF3Q9NS93 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TM7SF3Q9NS93 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TM7SF3Q9NS93 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TM7SF3Q9NS93 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TM7SF3Q9NS93 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TM7SF3Q9NS93 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TM7SF3Q9NS93 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TM7SF3Q9NS93 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TM7SF3Q9NS93 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TM7SF3Q9NS93 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TM7SF3Q9NS93 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TM7SF3Q9NS93 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TM7SF3Q9NS93 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TM7SF3Q9NS93 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TM7SF3Q9NS93 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TM7SF3Q9NS93 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TM7SF3Q9NS93 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TM7SF3Q9NS93 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TM7SF3Q9NS93 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TM7SF3Q9NS93 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TM7SF3Q9NS93 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TM7SF3Q9NS93 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TM7SF3Q9NS93 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TM7SF3Q9NS93 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TM7SF3Q9NS93 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TM7SF3Q9NS93 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TM7SF3Q9NS93 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TM7SF3Q9NS93 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TM7SF3Q9NS93 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TM7SF3Q9NS93 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TM7SF3Q9NS93 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TM7SF3Q9NS93 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TM7SF3Q9NS93 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TM7SF3Q9NS93 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TM7SF3Q9NS93 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TM7SF3Q9NS93 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TM7SF3Q9NS93 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TM7SF3Q9NS93 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TM7SF3Q9NS93 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TM7SF3Q9NS93 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TM7SF3Q9NS93 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TM7SF3Q9NS93 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TM7SF3Q9NS93 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.8 ms