Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS56

TOPORS, E3 ubiquitin-protein ligase Topors, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,045 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPORSQ9NS56 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TOPORSQ9NS56 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TOPORSQ9NS56 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TOPORSQ9NS56 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TOPORSQ9NS56 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TOPORSQ9NS56 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TOPORSQ9NS56 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TOPORSQ9NS56 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TOPORSQ9NS56 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TOPORSQ9NS56 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TOPORSQ9NS56 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TOPORSQ9NS56 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
TOPORSQ9NS56 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TOPORSQ9NS56 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TOPORSQ9NS56 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TOPORSQ9NS56 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TOPORSQ9NS56 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TOPORSQ9NS56 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TOPORSQ9NS56 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TOPORSQ9NS56 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TOPORSQ9NS56 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
TOPORSQ9NS56 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TOPORSQ9NS56 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TOPORSQ9NS56 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TOPORSQ9NS56 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TOPORSQ9NS56 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TOPORSQ9NS56 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TOPORSQ9NS56 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TOPORSQ9NS56 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TOPORSQ9NS56 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TOPORSQ9NS56 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TOPORSQ9NS56 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TOPORSQ9NS56 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TOPORSQ9NS56 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TOPORSQ9NS56 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TOPORSQ9NS56 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TOPORSQ9NS56 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TOPORSQ9NS56 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TOPORSQ9NS56 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TOPORSQ9NS56 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TOPORSQ9NS56 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TOPORSQ9NS56 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TOPORSQ9NS56 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TOPORSQ9NS56 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TOPORSQ9NS56 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
TOPORSQ9NS56 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
TOPORSQ9NS56 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TOPORSQ9NS56 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TOPORSQ9NS56 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TOPORSQ9NS56 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TOPORSQ9NS56 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TOPORSQ9NS56 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TOPORSQ9NS56 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TOPORSQ9NS56 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TOPORSQ9NS56 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TOPORSQ9NS56 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TOPORSQ9NS56 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TOPORSQ9NS56 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TOPORSQ9NS56 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
TOPORSQ9NS56 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TOPORSQ9NS56 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TOPORSQ9NS56 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
TOPORSQ9NS56 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TOPORSQ9NS56 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TOPORSQ9NS56 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TOPORSQ9NS56 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TOPORSQ9NS56 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TOPORSQ9NS56 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TOPORSQ9NS56 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TOPORSQ9NS56 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TOPORSQ9NS56 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TOPORSQ9NS56 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TOPORSQ9NS56 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TOPORSQ9NS56 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TOPORSQ9NS56 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
TOPORSQ9NS56 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TOPORSQ9NS56 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TOPORSQ9NS56 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TOPORSQ9NS56 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TOPORSQ9NS56 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TOPORSQ9NS56 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TOPORSQ9NS56 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TOPORSQ9NS56 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
TOPORSQ9NS56 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TOPORSQ9NS56 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TOPORSQ9NS56 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TOPORSQ9NS56 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TOPORSQ9NS56 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TOPORSQ9NS56 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TOPORSQ9NS56 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TOPORSQ9NS56 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TOPORSQ9NS56 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TOPORSQ9NS56 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TOPORSQ9NS56 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TOPORSQ9NS56 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TOPORSQ9NS56 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TOPORSQ9NS56 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TOPORSQ9NS56 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TOPORSQ9NS56 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TOPORSQ9NS56 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms