Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TIMMDC1Q9NPL8 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TIMMDC1Q9NPL8 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TIMMDC1Q9NPL8 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TIMMDC1Q9NPL8 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TIMMDC1Q9NPL8 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TIMMDC1Q9NPL8 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TIMMDC1Q9NPL8 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TIMMDC1Q9NPL8 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TIMMDC1Q9NPL8 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TIMMDC1Q9NPL8 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TIMMDC1Q9NPL8 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TIMMDC1Q9NPL8 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TIMMDC1Q9NPL8 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TIMMDC1Q9NPL8 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TIMMDC1Q9NPL8 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TIMMDC1Q9NPL8 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TIMMDC1Q9NPL8 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TIMMDC1Q9NPL8 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TIMMDC1Q9NPL8 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TIMMDC1Q9NPL8 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TIMMDC1Q9NPL8 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TIMMDC1Q9NPL8 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TIMMDC1Q9NPL8 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TIMMDC1Q9NPL8 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TIMMDC1Q9NPL8 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TIMMDC1Q9NPL8 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TIMMDC1Q9NPL8 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TIMMDC1Q9NPL8 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TIMMDC1Q9NPL8 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TIMMDC1Q9NPL8 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TIMMDC1Q9NPL8 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TIMMDC1Q9NPL8 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TIMMDC1Q9NPL8 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TIMMDC1Q9NPL8 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TIMMDC1Q9NPL8 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TIMMDC1Q9NPL8 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TIMMDC1Q9NPL8 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TIMMDC1Q9NPL8 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TIMMDC1Q9NPL8 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TIMMDC1Q9NPL8 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TIMMDC1Q9NPL8 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TIMMDC1Q9NPL8 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TIMMDC1Q9NPL8 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TIMMDC1Q9NPL8 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TIMMDC1Q9NPL8 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TIMMDC1Q9NPL8 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TIMMDC1Q9NPL8 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TIMMDC1Q9NPL8 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TIMMDC1Q9NPL8 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TIMMDC1Q9NPL8 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TIMMDC1Q9NPL8 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TIMMDC1Q9NPL8 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TIMMDC1Q9NPL8 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TIMMDC1Q9NPL8 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TIMMDC1Q9NPL8 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TIMMDC1Q9NPL8 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TIMMDC1Q9NPL8 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TIMMDC1Q9NPL8 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TIMMDC1Q9NPL8 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TIMMDC1Q9NPL8 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TIMMDC1Q9NPL8 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TIMMDC1Q9NPL8 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TIMMDC1Q9NPL8 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TIMMDC1Q9NPL8 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TIMMDC1Q9NPL8 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TIMMDC1Q9NPL8 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
TIMMDC1Q9NPL8 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TIMMDC1Q9NPL8 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TIMMDC1Q9NPL8 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TIMMDC1Q9NPL8 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TIMMDC1Q9NPL8 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TIMMDC1Q9NPL8 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TIMMDC1Q9NPL8 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TIMMDC1Q9NPL8 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TIMMDC1Q9NPL8 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TIMMDC1Q9NPL8 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TIMMDC1Q9NPL8 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TIMMDC1Q9NPL8 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TIMMDC1Q9NPL8 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TIMMDC1Q9NPL8 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TIMMDC1Q9NPL8 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TIMMDC1Q9NPL8 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TIMMDC1Q9NPL8 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TIMMDC1Q9NPL8 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TIMMDC1Q9NPL8 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TIMMDC1Q9NPL8 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TIMMDC1Q9NPL8 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TIMMDC1Q9NPL8 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TIMMDC1Q9NPL8 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TIMMDC1Q9NPL8 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TIMMDC1Q9NPL8 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TIMMDC1Q9NPL8 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TIMMDC1Q9NPL8 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms