Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP58

ABCB6, ATP-binding cassette sub-family B member 6, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB6Q9NP58 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ABCB6Q9NP58 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ABCB6Q9NP58 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
ABCB6Q9NP58 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
ABCB6Q9NP58 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ABCB6Q9NP58 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
ABCB6Q9NP58 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ABCB6Q9NP58 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ABCB6Q9NP58 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
ABCB6Q9NP58 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
ABCB6Q9NP58 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ABCB6Q9NP58 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ABCB6Q9NP58 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ABCB6Q9NP58 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ABCB6Q9NP58 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ABCB6Q9NP58 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ABCB6Q9NP58 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ABCB6Q9NP58 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ABCB6Q9NP58 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ABCB6Q9NP58 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ABCB6Q9NP58 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
ABCB6Q9NP58 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ABCB6Q9NP58 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ABCB6Q9NP58 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ABCB6Q9NP58 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ABCB6Q9NP58 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ABCB6Q9NP58 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ABCB6Q9NP58 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ABCB6Q9NP58 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
ABCB6Q9NP58 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ABCB6Q9NP58 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ABCB6Q9NP58 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ABCB6Q9NP58 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ABCB6Q9NP58 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ABCB6Q9NP58 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ABCB6Q9NP58 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ABCB6Q9NP58 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ABCB6Q9NP58 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ABCB6Q9NP58 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
ABCB6Q9NP58 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ABCB6Q9NP58 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ABCB6Q9NP58 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ABCB6Q9NP58 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ABCB6Q9NP58 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ABCB6Q9NP58 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ABCB6Q9NP58 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ABCB6Q9NP58 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ABCB6Q9NP58 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ABCB6Q9NP58 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ABCB6Q9NP58 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ABCB6Q9NP58 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ABCB6Q9NP58 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ABCB6Q9NP58 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ABCB6Q9NP58 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ABCB6Q9NP58 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ABCB6Q9NP58 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ABCB6Q9NP58 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ABCB6Q9NP58 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ABCB6Q9NP58 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
ABCB6Q9NP58 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ABCB6Q9NP58 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ABCB6Q9NP58 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ABCB6Q9NP58 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ABCB6Q9NP58 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
ABCB6Q9NP58 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ABCB6Q9NP58 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ABCB6Q9NP58 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ABCB6Q9NP58 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ABCB6Q9NP58 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ABCB6Q9NP58 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ABCB6Q9NP58 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ABCB6Q9NP58 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ABCB6Q9NP58 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ABCB6Q9NP58 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ABCB6Q9NP58 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ABCB6Q9NP58 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ABCB6Q9NP58 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ABCB6Q9NP58 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ABCB6Q9NP58 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ABCB6Q9NP58 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ABCB6Q9NP58 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ABCB6Q9NP58 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ABCB6Q9NP58 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ABCB6Q9NP58 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ABCB6Q9NP58 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ABCB6Q9NP58 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ABCB6Q9NP58 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ABCB6Q9NP58 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ABCB6Q9NP58 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ABCB6Q9NP58 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ABCB6Q9NP58 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ABCB6Q9NP58 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
ABCB6Q9NP58 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ABCB6Q9NP58 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ABCB6Q9NP58 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
ABCB6Q9NP58 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ABCB6Q9NP58 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ABCB6Q9NP58 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ABCB6Q9NP58 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
ABCB6Q9NP58 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms