Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCU8

POLD4, DNA polymerase delta subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD4Q9HCU8 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
POLD4Q9HCU8 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
POLD4Q9HCU8 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
POLD4Q9HCU8 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
POLD4Q9HCU8 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
POLD4Q9HCU8 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
POLD4Q9HCU8 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
POLD4Q9HCU8 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
POLD4Q9HCU8 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
POLD4Q9HCU8 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
POLD4Q9HCU8 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
POLD4Q9HCU8 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
POLD4Q9HCU8 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
POLD4Q9HCU8 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
POLD4Q9HCU8 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
POLD4Q9HCU8 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
POLD4Q9HCU8 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
POLD4Q9HCU8 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
POLD4Q9HCU8 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
POLD4Q9HCU8 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
POLD4Q9HCU8 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
POLD4Q9HCU8 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
POLD4Q9HCU8 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
POLD4Q9HCU8 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
POLD4Q9HCU8 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
POLD4Q9HCU8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
POLD4Q9HCU8 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
POLD4Q9HCU8 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
POLD4Q9HCU8 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
POLD4Q9HCU8 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
POLD4Q9HCU8 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
POLD4Q9HCU8 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
POLD4Q9HCU8 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
POLD4Q9HCU8 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
POLD4Q9HCU8 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
POLD4Q9HCU8 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
POLD4Q9HCU8 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
POLD4Q9HCU8 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
POLD4Q9HCU8 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
POLD4Q9HCU8 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
POLD4Q9HCU8 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
POLD4Q9HCU8 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
POLD4Q9HCU8 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
POLD4Q9HCU8 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
POLD4Q9HCU8 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
POLD4Q9HCU8 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
POLD4Q9HCU8 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
POLD4Q9HCU8 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
POLD4Q9HCU8 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
POLD4Q9HCU8 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
POLD4Q9HCU8 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
POLD4Q9HCU8 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
POLD4Q9HCU8 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
POLD4Q9HCU8 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
POLD4Q9HCU8 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
POLD4Q9HCU8 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
POLD4Q9HCU8 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
POLD4Q9HCU8 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
POLD4Q9HCU8 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
POLD4Q9HCU8 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
POLD4Q9HCU8 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
POLD4Q9HCU8 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
POLD4Q9HCU8 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
POLD4Q9HCU8 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
POLD4Q9HCU8 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
POLD4Q9HCU8 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
POLD4Q9HCU8 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
POLD4Q9HCU8 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
POLD4Q9HCU8 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
POLD4Q9HCU8 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
POLD4Q9HCU8 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
POLD4Q9HCU8 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
POLD4Q9HCU8 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
POLD4Q9HCU8 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
POLD4Q9HCU8 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
POLD4Q9HCU8 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
POLD4Q9HCU8 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
POLD4Q9HCU8 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
POLD4Q9HCU8 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
POLD4Q9HCU8 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
POLD4Q9HCU8 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
POLD4Q9HCU8 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
POLD4Q9HCU8 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
POLD4Q9HCU8 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
POLD4Q9HCU8 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
POLD4Q9HCU8 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
POLD4Q9HCU8 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
POLD4Q9HCU8 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
POLD4Q9HCU8 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
POLD4Q9HCU8 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
POLD4Q9HCU8 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
POLD4Q9HCU8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
POLD4Q9HCU8 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
POLD4Q9HCU8 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
POLD4Q9HCU8 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
POLD4Q9HCU8 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
POLD4Q9HCU8 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
POLD4Q9HCU8 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
POLD4Q9HCU8 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
POLD4Q9HCU8 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.7 ms