Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCS5

EPB41L4A, Band 4.1-like protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 686 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB41L4AQ9HCS5 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
EPB41L4AQ9HCS5 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
EPB41L4AQ9HCS5 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
EPB41L4AQ9HCS5 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
EPB41L4AQ9HCS5 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
EPB41L4AQ9HCS5 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
EPB41L4AQ9HCS5 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
EPB41L4AQ9HCS5 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
EPB41L4AQ9HCS5 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
EPB41L4AQ9HCS5 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
EPB41L4AQ9HCS5 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
EPB41L4AQ9HCS5 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
EPB41L4AQ9HCS5 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
EPB41L4AQ9HCS5 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
EPB41L4AQ9HCS5 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
EPB41L4AQ9HCS5 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
EPB41L4AQ9HCS5 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
EPB41L4AQ9HCS5 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
EPB41L4AQ9HCS5 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
EPB41L4AQ9HCS5 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
EPB41L4AQ9HCS5 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
EPB41L4AQ9HCS5 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
EPB41L4AQ9HCS5 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
EPB41L4AQ9HCS5 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
EPB41L4AQ9HCS5 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC28■■■□□ 2.07
EPB41L4AQ9HCS5 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
EPB41L4AQ9HCS5 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
EPB41L4AQ9HCS5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
EPB41L4AQ9HCS5 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
EPB41L4AQ9HCS5 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
EPB41L4AQ9HCS5 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
EPB41L4AQ9HCS5 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
EPB41L4AQ9HCS5 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
EPB41L4AQ9HCS5 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
EPB41L4AQ9HCS5 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
EPB41L4AQ9HCS5 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
EPB41L4AQ9HCS5 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
EPB41L4AQ9HCS5 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
EPB41L4AQ9HCS5 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
EPB41L4AQ9HCS5 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
EPB41L4AQ9HCS5 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
EPB41L4AQ9HCS5 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
EPB41L4AQ9HCS5 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
EPB41L4AQ9HCS5 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
EPB41L4AQ9HCS5 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
EPB41L4AQ9HCS5 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
EPB41L4AQ9HCS5 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
EPB41L4AQ9HCS5 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
EPB41L4AQ9HCS5 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
EPB41L4AQ9HCS5 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
EPB41L4AQ9HCS5 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
EPB41L4AQ9HCS5 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
EPB41L4AQ9HCS5 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
EPB41L4AQ9HCS5 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
EPB41L4AQ9HCS5 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
EPB41L4AQ9HCS5 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
EPB41L4AQ9HCS5 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
EPB41L4AQ9HCS5 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
EPB41L4AQ9HCS5 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
EPB41L4AQ9HCS5 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.06
EPB41L4AQ9HCS5 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
EPB41L4AQ9HCS5 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
EPB41L4AQ9HCS5 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
EPB41L4AQ9HCS5 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
EPB41L4AQ9HCS5 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
EPB41L4AQ9HCS5 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
EPB41L4AQ9HCS5 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
EPB41L4AQ9HCS5 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
EPB41L4AQ9HCS5 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
EPB41L4AQ9HCS5 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
EPB41L4AQ9HCS5 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
EPB41L4AQ9HCS5 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
EPB41L4AQ9HCS5 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
EPB41L4AQ9HCS5 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
EPB41L4AQ9HCS5 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
EPB41L4AQ9HCS5 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
EPB41L4AQ9HCS5 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
EPB41L4AQ9HCS5 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
EPB41L4AQ9HCS5 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
EPB41L4AQ9HCS5 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
EPB41L4AQ9HCS5 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
EPB41L4AQ9HCS5 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
EPB41L4AQ9HCS5 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
EPB41L4AQ9HCS5 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
EPB41L4AQ9HCS5 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
EPB41L4AQ9HCS5 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
EPB41L4AQ9HCS5 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
EPB41L4AQ9HCS5 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
EPB41L4AQ9HCS5 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
EPB41L4AQ9HCS5 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
EPB41L4AQ9HCS5 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
EPB41L4AQ9HCS5 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
EPB41L4AQ9HCS5 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
EPB41L4AQ9HCS5 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
EPB41L4AQ9HCS5 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
EPB41L4AQ9HCS5 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
EPB41L4AQ9HCS5 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
EPB41L4AQ9HCS5 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
EPB41L4AQ9HCS5 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
EPB41L4AQ9HCS5 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms