Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3S1

SEMA4A, Semaphorin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4AQ9H3S1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SEMA4AQ9H3S1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SEMA4AQ9H3S1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SEMA4AQ9H3S1 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SEMA4AQ9H3S1 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SEMA4AQ9H3S1 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SEMA4AQ9H3S1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SEMA4AQ9H3S1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SEMA4AQ9H3S1 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SEMA4AQ9H3S1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SEMA4AQ9H3S1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SEMA4AQ9H3S1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SEMA4AQ9H3S1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SEMA4AQ9H3S1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SEMA4AQ9H3S1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SEMA4AQ9H3S1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SEMA4AQ9H3S1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SEMA4AQ9H3S1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SEMA4AQ9H3S1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SEMA4AQ9H3S1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SEMA4AQ9H3S1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SEMA4AQ9H3S1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SEMA4AQ9H3S1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SEMA4AQ9H3S1 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SEMA4AQ9H3S1 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SEMA4AQ9H3S1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SEMA4AQ9H3S1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SEMA4AQ9H3S1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SEMA4AQ9H3S1 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SEMA4AQ9H3S1 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SEMA4AQ9H3S1 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SEMA4AQ9H3S1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SEMA4AQ9H3S1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SEMA4AQ9H3S1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SEMA4AQ9H3S1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SEMA4AQ9H3S1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SEMA4AQ9H3S1 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SEMA4AQ9H3S1 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SEMA4AQ9H3S1 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SEMA4AQ9H3S1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SEMA4AQ9H3S1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SEMA4AQ9H3S1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SEMA4AQ9H3S1 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SEMA4AQ9H3S1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SEMA4AQ9H3S1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SEMA4AQ9H3S1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SEMA4AQ9H3S1 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SEMA4AQ9H3S1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SEMA4AQ9H3S1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SEMA4AQ9H3S1 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SEMA4AQ9H3S1 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SEMA4AQ9H3S1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SEMA4AQ9H3S1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SEMA4AQ9H3S1 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SEMA4AQ9H3S1 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SEMA4AQ9H3S1 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SEMA4AQ9H3S1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SEMA4AQ9H3S1 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SEMA4AQ9H3S1 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SEMA4AQ9H3S1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SEMA4AQ9H3S1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SEMA4AQ9H3S1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SEMA4AQ9H3S1 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SEMA4AQ9H3S1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SEMA4AQ9H3S1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SEMA4AQ9H3S1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SEMA4AQ9H3S1 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SEMA4AQ9H3S1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SEMA4AQ9H3S1 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SEMA4AQ9H3S1 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SEMA4AQ9H3S1 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SEMA4AQ9H3S1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SEMA4AQ9H3S1 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SEMA4AQ9H3S1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SEMA4AQ9H3S1 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SEMA4AQ9H3S1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SEMA4AQ9H3S1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SEMA4AQ9H3S1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SEMA4AQ9H3S1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SEMA4AQ9H3S1 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SEMA4AQ9H3S1 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SEMA4AQ9H3S1 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SEMA4AQ9H3S1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SEMA4AQ9H3S1 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SEMA4AQ9H3S1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SEMA4AQ9H3S1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SEMA4AQ9H3S1 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SEMA4AQ9H3S1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SEMA4AQ9H3S1 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SEMA4AQ9H3S1 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SEMA4AQ9H3S1 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SEMA4AQ9H3S1 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SEMA4AQ9H3S1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SEMA4AQ9H3S1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SEMA4AQ9H3S1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SEMA4AQ9H3S1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SEMA4AQ9H3S1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SEMA4AQ9H3S1 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SEMA4AQ9H3S1 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SEMA4AQ9H3S1 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms