Protein–RNA interactions for Protein: Q9H320

VCX, Variable charge X-linked protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCXQ9H320 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VCXQ9H320 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VCXQ9H320 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VCXQ9H320 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VCXQ9H320 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VCXQ9H320 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VCXQ9H320 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VCXQ9H320 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VCXQ9H320 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VCXQ9H320 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VCXQ9H320 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
VCXQ9H320 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VCXQ9H320 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VCXQ9H320 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
VCXQ9H320 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VCXQ9H320 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
VCXQ9H320 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VCXQ9H320 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VCXQ9H320 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VCXQ9H320 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
VCXQ9H320 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
VCXQ9H320 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VCXQ9H320 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VCXQ9H320 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VCXQ9H320 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VCXQ9H320 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VCXQ9H320 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VCXQ9H320 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VCXQ9H320 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VCXQ9H320 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
VCXQ9H320 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VCXQ9H320 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VCXQ9H320 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VCXQ9H320 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VCXQ9H320 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VCXQ9H320 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VCXQ9H320 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VCXQ9H320 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VCXQ9H320 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VCXQ9H320 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VCXQ9H320 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VCXQ9H320 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VCXQ9H320 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VCXQ9H320 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VCXQ9H320 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
VCXQ9H320 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VCXQ9H320 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VCXQ9H320 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VCXQ9H320 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VCXQ9H320 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VCXQ9H320 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VCXQ9H320 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VCXQ9H320 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VCXQ9H320 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VCXQ9H320 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VCXQ9H320 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VCXQ9H320 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VCXQ9H320 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VCXQ9H320 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VCXQ9H320 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VCXQ9H320 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VCXQ9H320 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VCXQ9H320 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VCXQ9H320 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VCXQ9H320 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VCXQ9H320 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VCXQ9H320 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VCXQ9H320 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VCXQ9H320 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VCXQ9H320 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VCXQ9H320 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VCXQ9H320 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VCXQ9H320 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VCXQ9H320 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VCXQ9H320 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
VCXQ9H320 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VCXQ9H320 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
VCXQ9H320 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VCXQ9H320 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VCXQ9H320 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VCXQ9H320 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VCXQ9H320 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VCXQ9H320 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VCXQ9H320 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VCXQ9H320 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VCXQ9H320 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
VCXQ9H320 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VCXQ9H320 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VCXQ9H320 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VCXQ9H320 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VCXQ9H320 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VCXQ9H320 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VCXQ9H320 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VCXQ9H320 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VCXQ9H320 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VCXQ9H320 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VCXQ9H320 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VCXQ9H320 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VCXQ9H320 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VCXQ9H320 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms