Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ0

HOXD1, Homeobox protein Hox-D1, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1Q9GZZ0 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXD1Q9GZZ0 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXD1Q9GZZ0 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXD1Q9GZZ0 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXD1Q9GZZ0 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXD1Q9GZZ0 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXD1Q9GZZ0 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXD1Q9GZZ0 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXD1Q9GZZ0 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXD1Q9GZZ0 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXD1Q9GZZ0 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXD1Q9GZZ0 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXD1Q9GZZ0 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXD1Q9GZZ0 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXD1Q9GZZ0 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXD1Q9GZZ0 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXD1Q9GZZ0 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXD1Q9GZZ0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXD1Q9GZZ0 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXD1Q9GZZ0 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXD1Q9GZZ0 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXD1Q9GZZ0 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXD1Q9GZZ0 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXD1Q9GZZ0 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXD1Q9GZZ0 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXD1Q9GZZ0 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXD1Q9GZZ0 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXD1Q9GZZ0 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXD1Q9GZZ0 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXD1Q9GZZ0 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXD1Q9GZZ0 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXD1Q9GZZ0 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXD1Q9GZZ0 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXD1Q9GZZ0 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXD1Q9GZZ0 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXD1Q9GZZ0 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXD1Q9GZZ0 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXD1Q9GZZ0 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXD1Q9GZZ0 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXD1Q9GZZ0 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXD1Q9GZZ0 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXD1Q9GZZ0 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXD1Q9GZZ0 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXD1Q9GZZ0 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXD1Q9GZZ0 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXD1Q9GZZ0 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
HOXD1Q9GZZ0 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXD1Q9GZZ0 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXD1Q9GZZ0 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXD1Q9GZZ0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXD1Q9GZZ0 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXD1Q9GZZ0 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXD1Q9GZZ0 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXD1Q9GZZ0 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXD1Q9GZZ0 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXD1Q9GZZ0 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXD1Q9GZZ0 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXD1Q9GZZ0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXD1Q9GZZ0 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXD1Q9GZZ0 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXD1Q9GZZ0 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXD1Q9GZZ0 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXD1Q9GZZ0 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXD1Q9GZZ0 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXD1Q9GZZ0 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXD1Q9GZZ0 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXD1Q9GZZ0 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXD1Q9GZZ0 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXD1Q9GZZ0 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXD1Q9GZZ0 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXD1Q9GZZ0 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXD1Q9GZZ0 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXD1Q9GZZ0 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXD1Q9GZZ0 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXD1Q9GZZ0 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXD1Q9GZZ0 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXD1Q9GZZ0 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXD1Q9GZZ0 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXD1Q9GZZ0 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXD1Q9GZZ0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXD1Q9GZZ0 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXD1Q9GZZ0 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXD1Q9GZZ0 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXD1Q9GZZ0 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXD1Q9GZZ0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXD1Q9GZZ0 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXD1Q9GZZ0 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXD1Q9GZZ0 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXD1Q9GZZ0 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXD1Q9GZZ0 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXD1Q9GZZ0 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXD1Q9GZZ0 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXD1Q9GZZ0 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXD1Q9GZZ0 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
HOXD1Q9GZZ0 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXD1Q9GZZ0 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXD1Q9GZZ0 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXD1Q9GZZ0 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXD1Q9GZZ0 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXD1Q9GZZ0 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
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