Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KLHL4Q9C0H6 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KLHL4Q9C0H6 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KLHL4Q9C0H6 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KLHL4Q9C0H6 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KLHL4Q9C0H6 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KLHL4Q9C0H6 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KLHL4Q9C0H6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KLHL4Q9C0H6 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
KLHL4Q9C0H6 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KLHL4Q9C0H6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KLHL4Q9C0H6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
KLHL4Q9C0H6 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KLHL4Q9C0H6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KLHL4Q9C0H6 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KLHL4Q9C0H6 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KLHL4Q9C0H6 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KLHL4Q9C0H6 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KLHL4Q9C0H6 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KLHL4Q9C0H6 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KLHL4Q9C0H6 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KLHL4Q9C0H6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KLHL4Q9C0H6 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHL4Q9C0H6 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHL4Q9C0H6 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHL4Q9C0H6 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHL4Q9C0H6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHL4Q9C0H6 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHL4Q9C0H6 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHL4Q9C0H6 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHL4Q9C0H6 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHL4Q9C0H6 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHL4Q9C0H6 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHL4Q9C0H6 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHL4Q9C0H6 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHL4Q9C0H6 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHL4Q9C0H6 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHL4Q9C0H6 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHL4Q9C0H6 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHL4Q9C0H6 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHL4Q9C0H6 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHL4Q9C0H6 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHL4Q9C0H6 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHL4Q9C0H6 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHL4Q9C0H6 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHL4Q9C0H6 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHL4Q9C0H6 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHL4Q9C0H6 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHL4Q9C0H6 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHL4Q9C0H6 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHL4Q9C0H6 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHL4Q9C0H6 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHL4Q9C0H6 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHL4Q9C0H6 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHL4Q9C0H6 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHL4Q9C0H6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHL4Q9C0H6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHL4Q9C0H6 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHL4Q9C0H6 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHL4Q9C0H6 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KLHL4Q9C0H6 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KLHL4Q9C0H6 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KLHL4Q9C0H6 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLHL4Q9C0H6 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLHL4Q9C0H6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLHL4Q9C0H6 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLHL4Q9C0H6 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLHL4Q9C0H6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLHL4Q9C0H6 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLHL4Q9C0H6 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLHL4Q9C0H6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHL4Q9C0H6 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHL4Q9C0H6 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHL4Q9C0H6 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHL4Q9C0H6 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHL4Q9C0H6 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHL4Q9C0H6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHL4Q9C0H6 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHL4Q9C0H6 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHL4Q9C0H6 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHL4Q9C0H6 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHL4Q9C0H6 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHL4Q9C0H6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHL4Q9C0H6 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHL4Q9C0H6 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHL4Q9C0H6 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHL4Q9C0H6 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHL4Q9C0H6 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHL4Q9C0H6 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHL4Q9C0H6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHL4Q9C0H6 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHL4Q9C0H6 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHL4Q9C0H6 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHL4Q9C0H6 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHL4Q9C0H6 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHL4Q9C0H6 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHL4Q9C0H6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHL4Q9C0H6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHL4Q9C0H6 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHL4Q9C0H6 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.6 ms