Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVC6

TMEM109, Transmembrane protein 109, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM109Q9BVC6 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMEM109Q9BVC6 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMEM109Q9BVC6 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMEM109Q9BVC6 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMEM109Q9BVC6 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMEM109Q9BVC6 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMEM109Q9BVC6 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMEM109Q9BVC6 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM109Q9BVC6 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM109Q9BVC6 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM109Q9BVC6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM109Q9BVC6 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM109Q9BVC6 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM109Q9BVC6 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM109Q9BVC6 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM109Q9BVC6 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM109Q9BVC6 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM109Q9BVC6 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM109Q9BVC6 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM109Q9BVC6 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM109Q9BVC6 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM109Q9BVC6 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM109Q9BVC6 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM109Q9BVC6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM109Q9BVC6 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM109Q9BVC6 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM109Q9BVC6 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM109Q9BVC6 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM109Q9BVC6 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM109Q9BVC6 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM109Q9BVC6 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM109Q9BVC6 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM109Q9BVC6 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM109Q9BVC6 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM109Q9BVC6 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM109Q9BVC6 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM109Q9BVC6 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM109Q9BVC6 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM109Q9BVC6 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM109Q9BVC6 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM109Q9BVC6 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM109Q9BVC6 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM109Q9BVC6 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM109Q9BVC6 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM109Q9BVC6 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM109Q9BVC6 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM109Q9BVC6 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM109Q9BVC6 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM109Q9BVC6 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM109Q9BVC6 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM109Q9BVC6 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM109Q9BVC6 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM109Q9BVC6 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM109Q9BVC6 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM109Q9BVC6 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM109Q9BVC6 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM109Q9BVC6 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM109Q9BVC6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM109Q9BVC6 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TMEM109Q9BVC6 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TMEM109Q9BVC6 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMEM109Q9BVC6 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMEM109Q9BVC6 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM109Q9BVC6 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM109Q9BVC6 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM109Q9BVC6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM109Q9BVC6 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM109Q9BVC6 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM109Q9BVC6 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM109Q9BVC6 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM109Q9BVC6 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM109Q9BVC6 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM109Q9BVC6 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM109Q9BVC6 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM109Q9BVC6 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM109Q9BVC6 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM109Q9BVC6 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM109Q9BVC6 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM109Q9BVC6 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM109Q9BVC6 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM109Q9BVC6 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM109Q9BVC6 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM109Q9BVC6 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM109Q9BVC6 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM109Q9BVC6 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM109Q9BVC6 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM109Q9BVC6 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM109Q9BVC6 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM109Q9BVC6 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM109Q9BVC6 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM109Q9BVC6 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM109Q9BVC6 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM109Q9BVC6 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM109Q9BVC6 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM109Q9BVC6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM109Q9BVC6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM109Q9BVC6 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM109Q9BVC6 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM109Q9BVC6 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM109Q9BVC6 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms