Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT76

UPK3B, Uroplakin-3b, humanhuman

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK3BQ9BT76 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UPK3BQ9BT76 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UPK3BQ9BT76 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UPK3BQ9BT76 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UPK3BQ9BT76 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UPK3BQ9BT76 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
UPK3BQ9BT76 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
UPK3BQ9BT76 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UPK3BQ9BT76 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UPK3BQ9BT76 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UPK3BQ9BT76 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UPK3BQ9BT76 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UPK3BQ9BT76 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UPK3BQ9BT76 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
UPK3BQ9BT76 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UPK3BQ9BT76 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
UPK3BQ9BT76 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
UPK3BQ9BT76 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UPK3BQ9BT76 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UPK3BQ9BT76 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
UPK3BQ9BT76 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UPK3BQ9BT76 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UPK3BQ9BT76 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UPK3BQ9BT76 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UPK3BQ9BT76 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UPK3BQ9BT76 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
UPK3BQ9BT76 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UPK3BQ9BT76 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UPK3BQ9BT76 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UPK3BQ9BT76 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UPK3BQ9BT76 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UPK3BQ9BT76 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UPK3BQ9BT76 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UPK3BQ9BT76 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UPK3BQ9BT76 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UPK3BQ9BT76 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UPK3BQ9BT76 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UPK3BQ9BT76 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UPK3BQ9BT76 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UPK3BQ9BT76 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UPK3BQ9BT76 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UPK3BQ9BT76 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UPK3BQ9BT76 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UPK3BQ9BT76 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UPK3BQ9BT76 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UPK3BQ9BT76 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UPK3BQ9BT76 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UPK3BQ9BT76 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UPK3BQ9BT76 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UPK3BQ9BT76 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UPK3BQ9BT76 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UPK3BQ9BT76 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UPK3BQ9BT76 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
UPK3BQ9BT76 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
UPK3BQ9BT76 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UPK3BQ9BT76 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UPK3BQ9BT76 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UPK3BQ9BT76 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UPK3BQ9BT76 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UPK3BQ9BT76 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
UPK3BQ9BT76 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UPK3BQ9BT76 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UPK3BQ9BT76 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UPK3BQ9BT76 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UPK3BQ9BT76 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UPK3BQ9BT76 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UPK3BQ9BT76 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
UPK3BQ9BT76 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UPK3BQ9BT76 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UPK3BQ9BT76 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UPK3BQ9BT76 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UPK3BQ9BT76 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UPK3BQ9BT76 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
UPK3BQ9BT76 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UPK3BQ9BT76 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UPK3BQ9BT76 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UPK3BQ9BT76 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UPK3BQ9BT76 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UPK3BQ9BT76 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UPK3BQ9BT76 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UPK3BQ9BT76 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UPK3BQ9BT76 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UPK3BQ9BT76 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UPK3BQ9BT76 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
UPK3BQ9BT76 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UPK3BQ9BT76 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UPK3BQ9BT76 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UPK3BQ9BT76 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UPK3BQ9BT76 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UPK3BQ9BT76 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UPK3BQ9BT76 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UPK3BQ9BT76 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UPK3BQ9BT76 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UPK3BQ9BT76 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UPK3BQ9BT76 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UPK3BQ9BT76 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UPK3BQ9BT76 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UPK3BQ9BT76 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UPK3BQ9BT76 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UPK3BQ9BT76 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms