Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRV8

SIKE1, Suppressor of IKBKE 1, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIKE1Q9BRV8 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SIKE1Q9BRV8 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SIKE1Q9BRV8 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SIKE1Q9BRV8 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SIKE1Q9BRV8 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SIKE1Q9BRV8 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SIKE1Q9BRV8 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SIKE1Q9BRV8 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SIKE1Q9BRV8 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SIKE1Q9BRV8 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SIKE1Q9BRV8 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SIKE1Q9BRV8 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SIKE1Q9BRV8 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SIKE1Q9BRV8 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SIKE1Q9BRV8 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SIKE1Q9BRV8 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SIKE1Q9BRV8 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SIKE1Q9BRV8 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SIKE1Q9BRV8 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SIKE1Q9BRV8 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SIKE1Q9BRV8 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SIKE1Q9BRV8 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SIKE1Q9BRV8 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SIKE1Q9BRV8 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SIKE1Q9BRV8 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SIKE1Q9BRV8 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SIKE1Q9BRV8 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SIKE1Q9BRV8 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SIKE1Q9BRV8 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SIKE1Q9BRV8 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SIKE1Q9BRV8 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SIKE1Q9BRV8 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SIKE1Q9BRV8 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SIKE1Q9BRV8 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SIKE1Q9BRV8 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SIKE1Q9BRV8 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SIKE1Q9BRV8 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SIKE1Q9BRV8 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SIKE1Q9BRV8 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SIKE1Q9BRV8 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SIKE1Q9BRV8 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SIKE1Q9BRV8 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SIKE1Q9BRV8 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SIKE1Q9BRV8 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SIKE1Q9BRV8 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SIKE1Q9BRV8 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SIKE1Q9BRV8 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SIKE1Q9BRV8 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SIKE1Q9BRV8 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SIKE1Q9BRV8 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SIKE1Q9BRV8 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SIKE1Q9BRV8 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SIKE1Q9BRV8 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SIKE1Q9BRV8 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SIKE1Q9BRV8 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SIKE1Q9BRV8 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SIKE1Q9BRV8 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SIKE1Q9BRV8 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SIKE1Q9BRV8 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SIKE1Q9BRV8 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SIKE1Q9BRV8 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SIKE1Q9BRV8 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SIKE1Q9BRV8 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SIKE1Q9BRV8 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SIKE1Q9BRV8 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SIKE1Q9BRV8 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SIKE1Q9BRV8 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SIKE1Q9BRV8 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SIKE1Q9BRV8 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SIKE1Q9BRV8 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SIKE1Q9BRV8 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SIKE1Q9BRV8 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SIKE1Q9BRV8 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SIKE1Q9BRV8 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SIKE1Q9BRV8 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SIKE1Q9BRV8 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SIKE1Q9BRV8 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SIKE1Q9BRV8 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SIKE1Q9BRV8 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SIKE1Q9BRV8 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SIKE1Q9BRV8 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SIKE1Q9BRV8 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SIKE1Q9BRV8 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIKE1Q9BRV8 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIKE1Q9BRV8 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIKE1Q9BRV8 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIKE1Q9BRV8 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIKE1Q9BRV8 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIKE1Q9BRV8 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIKE1Q9BRV8 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIKE1Q9BRV8 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIKE1Q9BRV8 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIKE1Q9BRV8 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIKE1Q9BRV8 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIKE1Q9BRV8 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIKE1Q9BRV8 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIKE1Q9BRV8 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIKE1Q9BRV8 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIKE1Q9BRV8 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIKE1Q9BRV8 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms