Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR11

ZSWIM1, Zinc finger SWIM domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZSWIM1Q9BR11 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZSWIM1Q9BR11 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZSWIM1Q9BR11 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZSWIM1Q9BR11 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZSWIM1Q9BR11 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
ZSWIM1Q9BR11 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZSWIM1Q9BR11 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZSWIM1Q9BR11 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZSWIM1Q9BR11 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZSWIM1Q9BR11 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZSWIM1Q9BR11 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZSWIM1Q9BR11 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZSWIM1Q9BR11 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZSWIM1Q9BR11 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZSWIM1Q9BR11 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZSWIM1Q9BR11 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZSWIM1Q9BR11 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZSWIM1Q9BR11 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZSWIM1Q9BR11 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZSWIM1Q9BR11 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZSWIM1Q9BR11 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZSWIM1Q9BR11 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZSWIM1Q9BR11 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZSWIM1Q9BR11 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZSWIM1Q9BR11 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZSWIM1Q9BR11 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZSWIM1Q9BR11 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZSWIM1Q9BR11 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZSWIM1Q9BR11 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZSWIM1Q9BR11 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
ZSWIM1Q9BR11 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.6
ZSWIM1Q9BR11 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZSWIM1Q9BR11 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZSWIM1Q9BR11 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZSWIM1Q9BR11 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZSWIM1Q9BR11 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZSWIM1Q9BR11 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
ZSWIM1Q9BR11 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZSWIM1Q9BR11 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZSWIM1Q9BR11 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZSWIM1Q9BR11 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZSWIM1Q9BR11 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZSWIM1Q9BR11 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZSWIM1Q9BR11 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZSWIM1Q9BR11 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZSWIM1Q9BR11 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZSWIM1Q9BR11 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZSWIM1Q9BR11 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZSWIM1Q9BR11 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZSWIM1Q9BR11 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZSWIM1Q9BR11 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZSWIM1Q9BR11 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZSWIM1Q9BR11 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ZSWIM1Q9BR11 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZSWIM1Q9BR11 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZSWIM1Q9BR11 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZSWIM1Q9BR11 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZSWIM1Q9BR11 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZSWIM1Q9BR11 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZSWIM1Q9BR11 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZSWIM1Q9BR11 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZSWIM1Q9BR11 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZSWIM1Q9BR11 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZSWIM1Q9BR11 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZSWIM1Q9BR11 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZSWIM1Q9BR11 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZSWIM1Q9BR11 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZSWIM1Q9BR11 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZSWIM1Q9BR11 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZSWIM1Q9BR11 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZSWIM1Q9BR11 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
ZSWIM1Q9BR11 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZSWIM1Q9BR11 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZSWIM1Q9BR11 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZSWIM1Q9BR11 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZSWIM1Q9BR11 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZSWIM1Q9BR11 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZSWIM1Q9BR11 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
ZSWIM1Q9BR11 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZSWIM1Q9BR11 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZSWIM1Q9BR11 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZSWIM1Q9BR11 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZSWIM1Q9BR11 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZSWIM1Q9BR11 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZSWIM1Q9BR11 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZSWIM1Q9BR11 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZSWIM1Q9BR11 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZSWIM1Q9BR11 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZSWIM1Q9BR11 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZSWIM1Q9BR11 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZSWIM1Q9BR11 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ZSWIM1Q9BR11 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ZSWIM1Q9BR11 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
ZSWIM1Q9BR11 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
ZSWIM1Q9BR11 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZSWIM1Q9BR11 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ZSWIM1Q9BR11 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZSWIM1Q9BR11 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZSWIM1Q9BR11 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZSWIM1Q9BR11 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.3 ms