Protein–RNA interactions for Protein: Q99999

GAL3ST1, Galactosylceramide sulfotransferase, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAL3ST1Q99999 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GAL3ST1Q99999 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GAL3ST1Q99999 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GAL3ST1Q99999 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GAL3ST1Q99999 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GAL3ST1Q99999 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GAL3ST1Q99999 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GAL3ST1Q99999 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GAL3ST1Q99999 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GAL3ST1Q99999 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GAL3ST1Q99999 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
GAL3ST1Q99999 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GAL3ST1Q99999 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
GAL3ST1Q99999 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GAL3ST1Q99999 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GAL3ST1Q99999 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GAL3ST1Q99999 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GAL3ST1Q99999 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GAL3ST1Q99999 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GAL3ST1Q99999 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GAL3ST1Q99999 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GAL3ST1Q99999 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GAL3ST1Q99999 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GAL3ST1Q99999 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
GAL3ST1Q99999 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GAL3ST1Q99999 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GAL3ST1Q99999 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GAL3ST1Q99999 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GAL3ST1Q99999 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GAL3ST1Q99999 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GAL3ST1Q99999 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GAL3ST1Q99999 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GAL3ST1Q99999 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
GAL3ST1Q99999 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GAL3ST1Q99999 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GAL3ST1Q99999 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GAL3ST1Q99999 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GAL3ST1Q99999 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GAL3ST1Q99999 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GAL3ST1Q99999 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GAL3ST1Q99999 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GAL3ST1Q99999 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GAL3ST1Q99999 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GAL3ST1Q99999 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GAL3ST1Q99999 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
GAL3ST1Q99999 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GAL3ST1Q99999 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GAL3ST1Q99999 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
GAL3ST1Q99999 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
GAL3ST1Q99999 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GAL3ST1Q99999 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GAL3ST1Q99999 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GAL3ST1Q99999 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GAL3ST1Q99999 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GAL3ST1Q99999 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GAL3ST1Q99999 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GAL3ST1Q99999 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GAL3ST1Q99999 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GAL3ST1Q99999 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GAL3ST1Q99999 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GAL3ST1Q99999 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GAL3ST1Q99999 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GAL3ST1Q99999 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GAL3ST1Q99999 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GAL3ST1Q99999 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GAL3ST1Q99999 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GAL3ST1Q99999 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GAL3ST1Q99999 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GAL3ST1Q99999 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GAL3ST1Q99999 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GAL3ST1Q99999 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GAL3ST1Q99999 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GAL3ST1Q99999 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GAL3ST1Q99999 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GAL3ST1Q99999 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GAL3ST1Q99999 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GAL3ST1Q99999 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GAL3ST1Q99999 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GAL3ST1Q99999 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GAL3ST1Q99999 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GAL3ST1Q99999 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GAL3ST1Q99999 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
GAL3ST1Q99999 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GAL3ST1Q99999 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GAL3ST1Q99999 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GAL3ST1Q99999 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GAL3ST1Q99999 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GAL3ST1Q99999 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GAL3ST1Q99999 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GAL3ST1Q99999 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GAL3ST1Q99999 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GAL3ST1Q99999 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GAL3ST1Q99999 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GAL3ST1Q99999 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GAL3ST1Q99999 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GAL3ST1Q99999 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GAL3ST1Q99999 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GAL3ST1Q99999 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GAL3ST1Q99999 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GAL3ST1Q99999 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms