Protein–RNA interactions for Protein: Q99742

NPAS1, Neuronal PAS domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS1Q99742 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NPAS1Q99742 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NPAS1Q99742 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NPAS1Q99742 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NPAS1Q99742 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NPAS1Q99742 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NPAS1Q99742 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NPAS1Q99742 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NPAS1Q99742 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NPAS1Q99742 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NPAS1Q99742 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NPAS1Q99742 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NPAS1Q99742 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NPAS1Q99742 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
NPAS1Q99742 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NPAS1Q99742 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NPAS1Q99742 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NPAS1Q99742 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NPAS1Q99742 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NPAS1Q99742 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NPAS1Q99742 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NPAS1Q99742 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NPAS1Q99742 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NPAS1Q99742 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NPAS1Q99742 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NPAS1Q99742 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NPAS1Q99742 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NPAS1Q99742 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NPAS1Q99742 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NPAS1Q99742 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NPAS1Q99742 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NPAS1Q99742 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NPAS1Q99742 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NPAS1Q99742 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NPAS1Q99742 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NPAS1Q99742 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NPAS1Q99742 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NPAS1Q99742 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NPAS1Q99742 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NPAS1Q99742 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NPAS1Q99742 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NPAS1Q99742 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NPAS1Q99742 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NPAS1Q99742 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NPAS1Q99742 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NPAS1Q99742 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NPAS1Q99742 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NPAS1Q99742 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NPAS1Q99742 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NPAS1Q99742 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NPAS1Q99742 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NPAS1Q99742 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NPAS1Q99742 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NPAS1Q99742 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NPAS1Q99742 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NPAS1Q99742 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NPAS1Q99742 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NPAS1Q99742 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NPAS1Q99742 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NPAS1Q99742 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NPAS1Q99742 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NPAS1Q99742 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NPAS1Q99742 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NPAS1Q99742 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
NPAS1Q99742 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NPAS1Q99742 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NPAS1Q99742 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
NPAS1Q99742 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NPAS1Q99742 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NPAS1Q99742 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NPAS1Q99742 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NPAS1Q99742 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NPAS1Q99742 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NPAS1Q99742 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NPAS1Q99742 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NPAS1Q99742 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NPAS1Q99742 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NPAS1Q99742 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NPAS1Q99742 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NPAS1Q99742 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NPAS1Q99742 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NPAS1Q99742 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NPAS1Q99742 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NPAS1Q99742 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NPAS1Q99742 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NPAS1Q99742 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NPAS1Q99742 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NPAS1Q99742 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NPAS1Q99742 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NPAS1Q99742 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NPAS1Q99742 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NPAS1Q99742 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NPAS1Q99742 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NPAS1Q99742 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NPAS1Q99742 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NPAS1Q99742 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NPAS1Q99742 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NPAS1Q99742 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NPAS1Q99742 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NPAS1Q99742 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms