Protein–RNA interactions for Protein: Q99720

SIGMAR1, Sigma non-opioid intracellular receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIGMAR1Q99720 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SIGMAR1Q99720 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SIGMAR1Q99720 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SIGMAR1Q99720 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SIGMAR1Q99720 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SIGMAR1Q99720 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SIGMAR1Q99720 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SIGMAR1Q99720 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SIGMAR1Q99720 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SIGMAR1Q99720 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SIGMAR1Q99720 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SIGMAR1Q99720 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SIGMAR1Q99720 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SIGMAR1Q99720 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SIGMAR1Q99720 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SIGMAR1Q99720 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SIGMAR1Q99720 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SIGMAR1Q99720 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SIGMAR1Q99720 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SIGMAR1Q99720 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SIGMAR1Q99720 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SIGMAR1Q99720 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SIGMAR1Q99720 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SIGMAR1Q99720 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SIGMAR1Q99720 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SIGMAR1Q99720 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SIGMAR1Q99720 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SIGMAR1Q99720 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SIGMAR1Q99720 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIGMAR1Q99720 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIGMAR1Q99720 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SIGMAR1Q99720 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIGMAR1Q99720 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIGMAR1Q99720 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIGMAR1Q99720 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIGMAR1Q99720 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIGMAR1Q99720 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIGMAR1Q99720 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIGMAR1Q99720 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIGMAR1Q99720 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIGMAR1Q99720 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIGMAR1Q99720 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIGMAR1Q99720 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIGMAR1Q99720 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SIGMAR1Q99720 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SIGMAR1Q99720 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SIGMAR1Q99720 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SIGMAR1Q99720 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SIGMAR1Q99720 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SIGMAR1Q99720 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SIGMAR1Q99720 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SIGMAR1Q99720 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SIGMAR1Q99720 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SIGMAR1Q99720 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SIGMAR1Q99720 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SIGMAR1Q99720 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SIGMAR1Q99720 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SIGMAR1Q99720 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SIGMAR1Q99720 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SIGMAR1Q99720 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SIGMAR1Q99720 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SIGMAR1Q99720 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SIGMAR1Q99720 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SIGMAR1Q99720 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SIGMAR1Q99720 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SIGMAR1Q99720 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SIGMAR1Q99720 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SIGMAR1Q99720 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SIGMAR1Q99720 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SIGMAR1Q99720 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SIGMAR1Q99720 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SIGMAR1Q99720 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SIGMAR1Q99720 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SIGMAR1Q99720 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SIGMAR1Q99720 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SIGMAR1Q99720 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SIGMAR1Q99720 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SIGMAR1Q99720 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SIGMAR1Q99720 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SIGMAR1Q99720 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SIGMAR1Q99720 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SIGMAR1Q99720 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SIGMAR1Q99720 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SIGMAR1Q99720 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SIGMAR1Q99720 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SIGMAR1Q99720 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SIGMAR1Q99720 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SIGMAR1Q99720 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SIGMAR1Q99720 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SIGMAR1Q99720 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SIGMAR1Q99720 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SIGMAR1Q99720 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SIGMAR1Q99720 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SIGMAR1Q99720 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SIGMAR1Q99720 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SIGMAR1Q99720 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SIGMAR1Q99720 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SIGMAR1Q99720 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SIGMAR1Q99720 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SIGMAR1Q99720 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms