Protein–RNA interactions for Protein: Q96T76

MMS19, MMS19 nucleotide excision repair protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,030 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMS19Q96T76 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MMS19Q96T76 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MMS19Q96T76 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MMS19Q96T76 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MMS19Q96T76 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MMS19Q96T76 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MMS19Q96T76 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MMS19Q96T76 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MMS19Q96T76 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MMS19Q96T76 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MMS19Q96T76 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
MMS19Q96T76 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MMS19Q96T76 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MMS19Q96T76 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MMS19Q96T76 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MMS19Q96T76 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MMS19Q96T76 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MMS19Q96T76 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MMS19Q96T76 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MMS19Q96T76 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MMS19Q96T76 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MMS19Q96T76 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MMS19Q96T76 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MMS19Q96T76 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MMS19Q96T76 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MMS19Q96T76 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MMS19Q96T76 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MMS19Q96T76 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MMS19Q96T76 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MMS19Q96T76 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MMS19Q96T76 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MMS19Q96T76 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MMS19Q96T76 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MMS19Q96T76 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MMS19Q96T76 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MMS19Q96T76 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MMS19Q96T76 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
MMS19Q96T76 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MMS19Q96T76 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MMS19Q96T76 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MMS19Q96T76 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MMS19Q96T76 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MMS19Q96T76 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MMS19Q96T76 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MMS19Q96T76 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MMS19Q96T76 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MMS19Q96T76 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MMS19Q96T76 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MMS19Q96T76 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MMS19Q96T76 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MMS19Q96T76 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MMS19Q96T76 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MMS19Q96T76 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MMS19Q96T76 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MMS19Q96T76 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MMS19Q96T76 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MMS19Q96T76 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MMS19Q96T76 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MMS19Q96T76 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MMS19Q96T76 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MMS19Q96T76 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MMS19Q96T76 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MMS19Q96T76 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MMS19Q96T76 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MMS19Q96T76 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MMS19Q96T76 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MMS19Q96T76 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MMS19Q96T76 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MMS19Q96T76 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MMS19Q96T76 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MMS19Q96T76 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MMS19Q96T76 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MMS19Q96T76 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MMS19Q96T76 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MMS19Q96T76 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MMS19Q96T76 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MMS19Q96T76 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MMS19Q96T76 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
MMS19Q96T76 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MMS19Q96T76 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MMS19Q96T76 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
MMS19Q96T76 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MMS19Q96T76 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MMS19Q96T76 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MMS19Q96T76 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MMS19Q96T76 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MMS19Q96T76 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MMS19Q96T76 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
MMS19Q96T76 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MMS19Q96T76 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MMS19Q96T76 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MMS19Q96T76 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MMS19Q96T76 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
MMS19Q96T76 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MMS19Q96T76 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MMS19Q96T76 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MMS19Q96T76 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MMS19Q96T76 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MMS19Q96T76 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MMS19Q96T76 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms