Protein–RNA interactions for Protein: Q96PE6

ZIM3, Zinc finger imprinted 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIM3Q96PE6 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZIM3Q96PE6 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZIM3Q96PE6 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZIM3Q96PE6 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ZIM3Q96PE6 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZIM3Q96PE6 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZIM3Q96PE6 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZIM3Q96PE6 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZIM3Q96PE6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ZIM3Q96PE6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZIM3Q96PE6 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZIM3Q96PE6 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZIM3Q96PE6 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZIM3Q96PE6 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZIM3Q96PE6 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ZIM3Q96PE6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZIM3Q96PE6 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZIM3Q96PE6 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZIM3Q96PE6 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZIM3Q96PE6 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ZIM3Q96PE6 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZIM3Q96PE6 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZIM3Q96PE6 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZIM3Q96PE6 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZIM3Q96PE6 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZIM3Q96PE6 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZIM3Q96PE6 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZIM3Q96PE6 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZIM3Q96PE6 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZIM3Q96PE6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZIM3Q96PE6 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ZIM3Q96PE6 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZIM3Q96PE6 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZIM3Q96PE6 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZIM3Q96PE6 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZIM3Q96PE6 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZIM3Q96PE6 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
ZIM3Q96PE6 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZIM3Q96PE6 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZIM3Q96PE6 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZIM3Q96PE6 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZIM3Q96PE6 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZIM3Q96PE6 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZIM3Q96PE6 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZIM3Q96PE6 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ZIM3Q96PE6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZIM3Q96PE6 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZIM3Q96PE6 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZIM3Q96PE6 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ZIM3Q96PE6 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZIM3Q96PE6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZIM3Q96PE6 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZIM3Q96PE6 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZIM3Q96PE6 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
ZIM3Q96PE6 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZIM3Q96PE6 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZIM3Q96PE6 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZIM3Q96PE6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZIM3Q96PE6 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
ZIM3Q96PE6 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZIM3Q96PE6 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZIM3Q96PE6 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZIM3Q96PE6 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZIM3Q96PE6 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZIM3Q96PE6 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZIM3Q96PE6 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZIM3Q96PE6 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZIM3Q96PE6 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZIM3Q96PE6 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZIM3Q96PE6 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZIM3Q96PE6 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZIM3Q96PE6 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZIM3Q96PE6 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZIM3Q96PE6 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZIM3Q96PE6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZIM3Q96PE6 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZIM3Q96PE6 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZIM3Q96PE6 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZIM3Q96PE6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZIM3Q96PE6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZIM3Q96PE6 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZIM3Q96PE6 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ZIM3Q96PE6 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ZIM3Q96PE6 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ZIM3Q96PE6 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ZIM3Q96PE6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZIM3Q96PE6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
ZIM3Q96PE6 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZIM3Q96PE6 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZIM3Q96PE6 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZIM3Q96PE6 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZIM3Q96PE6 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZIM3Q96PE6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZIM3Q96PE6 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZIM3Q96PE6 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZIM3Q96PE6 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZIM3Q96PE6 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZIM3Q96PE6 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZIM3Q96PE6 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
ZIM3Q96PE6 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms