Protein–RNA interactions for Protein: Q96N28

PRELID3A, PRELI domain containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRELID3AQ96N28 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRELID3AQ96N28 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRELID3AQ96N28 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRELID3AQ96N28 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRELID3AQ96N28 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRELID3AQ96N28 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRELID3AQ96N28 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRELID3AQ96N28 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRELID3AQ96N28 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRELID3AQ96N28 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PRELID3AQ96N28 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRELID3AQ96N28 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRELID3AQ96N28 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRELID3AQ96N28 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRELID3AQ96N28 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRELID3AQ96N28 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRELID3AQ96N28 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRELID3AQ96N28 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRELID3AQ96N28 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRELID3AQ96N28 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRELID3AQ96N28 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRELID3AQ96N28 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRELID3AQ96N28 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PRELID3AQ96N28 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRELID3AQ96N28 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRELID3AQ96N28 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRELID3AQ96N28 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRELID3AQ96N28 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
PRELID3AQ96N28 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRELID3AQ96N28 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRELID3AQ96N28 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PRELID3AQ96N28 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PRELID3AQ96N28 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRELID3AQ96N28 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRELID3AQ96N28 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRELID3AQ96N28 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRELID3AQ96N28 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRELID3AQ96N28 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRELID3AQ96N28 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PRELID3AQ96N28 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRELID3AQ96N28 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRELID3AQ96N28 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRELID3AQ96N28 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRELID3AQ96N28 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRELID3AQ96N28 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRELID3AQ96N28 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRELID3AQ96N28 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRELID3AQ96N28 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRELID3AQ96N28 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PRELID3AQ96N28 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PRELID3AQ96N28 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PRELID3AQ96N28 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PRELID3AQ96N28 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PRELID3AQ96N28 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PRELID3AQ96N28 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PRELID3AQ96N28 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PRELID3AQ96N28 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PRELID3AQ96N28 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PRELID3AQ96N28 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PRELID3AQ96N28 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PRELID3AQ96N28 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PRELID3AQ96N28 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PRELID3AQ96N28 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PRELID3AQ96N28 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PRELID3AQ96N28 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PRELID3AQ96N28 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PRELID3AQ96N28 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PRELID3AQ96N28 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PRELID3AQ96N28 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PRELID3AQ96N28 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PRELID3AQ96N28 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PRELID3AQ96N28 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PRELID3AQ96N28 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PRELID3AQ96N28 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PRELID3AQ96N28 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PRELID3AQ96N28 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PRELID3AQ96N28 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PRELID3AQ96N28 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PRELID3AQ96N28 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PRELID3AQ96N28 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PRELID3AQ96N28 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PRELID3AQ96N28 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PRELID3AQ96N28 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PRELID3AQ96N28 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PRELID3AQ96N28 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PRELID3AQ96N28 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PRELID3AQ96N28 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PRELID3AQ96N28 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PRELID3AQ96N28 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PRELID3AQ96N28 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PRELID3AQ96N28 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PRELID3AQ96N28 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PRELID3AQ96N28 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PRELID3AQ96N28 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRELID3AQ96N28 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRELID3AQ96N28 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRELID3AQ96N28 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRELID3AQ96N28 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRELID3AQ96N28 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRELID3AQ96N28 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms