Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ0

DCHS1, Protocadherin-16, humanhuman

Predictions only

Length 3,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCHS1Q96JQ0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DCHS1Q96JQ0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DCHS1Q96JQ0 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DCHS1Q96JQ0 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DCHS1Q96JQ0 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DCHS1Q96JQ0 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
DCHS1Q96JQ0 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
DCHS1Q96JQ0 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
DCHS1Q96JQ0 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
DCHS1Q96JQ0 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DCHS1Q96JQ0 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DCHS1Q96JQ0 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DCHS1Q96JQ0 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DCHS1Q96JQ0 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DCHS1Q96JQ0 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DCHS1Q96JQ0 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DCHS1Q96JQ0 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DCHS1Q96JQ0 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DCHS1Q96JQ0 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DCHS1Q96JQ0 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DCHS1Q96JQ0 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DCHS1Q96JQ0 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DCHS1Q96JQ0 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DCHS1Q96JQ0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DCHS1Q96JQ0 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DCHS1Q96JQ0 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DCHS1Q96JQ0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DCHS1Q96JQ0 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DCHS1Q96JQ0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
DCHS1Q96JQ0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
DCHS1Q96JQ0 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
DCHS1Q96JQ0 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DCHS1Q96JQ0 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DCHS1Q96JQ0 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DCHS1Q96JQ0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DCHS1Q96JQ0 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DCHS1Q96JQ0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
DCHS1Q96JQ0 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DCHS1Q96JQ0 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DCHS1Q96JQ0 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DCHS1Q96JQ0 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DCHS1Q96JQ0 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DCHS1Q96JQ0 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DCHS1Q96JQ0 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DCHS1Q96JQ0 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
DCHS1Q96JQ0 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DCHS1Q96JQ0 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DCHS1Q96JQ0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DCHS1Q96JQ0 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
DCHS1Q96JQ0 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DCHS1Q96JQ0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DCHS1Q96JQ0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DCHS1Q96JQ0 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DCHS1Q96JQ0 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DCHS1Q96JQ0 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DCHS1Q96JQ0 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DCHS1Q96JQ0 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
DCHS1Q96JQ0 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DCHS1Q96JQ0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DCHS1Q96JQ0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DCHS1Q96JQ0 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DCHS1Q96JQ0 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DCHS1Q96JQ0 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DCHS1Q96JQ0 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DCHS1Q96JQ0 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DCHS1Q96JQ0 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DCHS1Q96JQ0 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DCHS1Q96JQ0 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DCHS1Q96JQ0 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DCHS1Q96JQ0 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DCHS1Q96JQ0 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DCHS1Q96JQ0 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DCHS1Q96JQ0 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DCHS1Q96JQ0 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DCHS1Q96JQ0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DCHS1Q96JQ0 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DCHS1Q96JQ0 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DCHS1Q96JQ0 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DCHS1Q96JQ0 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DCHS1Q96JQ0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DCHS1Q96JQ0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
DCHS1Q96JQ0 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DCHS1Q96JQ0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
DCHS1Q96JQ0 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
DCHS1Q96JQ0 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DCHS1Q96JQ0 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DCHS1Q96JQ0 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DCHS1Q96JQ0 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DCHS1Q96JQ0 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DCHS1Q96JQ0 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DCHS1Q96JQ0 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DCHS1Q96JQ0 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DCHS1Q96JQ0 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DCHS1Q96JQ0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DCHS1Q96JQ0 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DCHS1Q96JQ0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DCHS1Q96JQ0 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DCHS1Q96JQ0 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DCHS1Q96JQ0 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DCHS1Q96JQ0 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms