Protein–RNA interactions for Protein: Q96FW1

OTUB1, Ubiquitin thioesterase OTUB1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUB1Q96FW1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
OTUB1Q96FW1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
OTUB1Q96FW1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
OTUB1Q96FW1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
OTUB1Q96FW1 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
OTUB1Q96FW1 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
OTUB1Q96FW1 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
OTUB1Q96FW1 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
OTUB1Q96FW1 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
OTUB1Q96FW1 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
OTUB1Q96FW1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
OTUB1Q96FW1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
OTUB1Q96FW1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
OTUB1Q96FW1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
OTUB1Q96FW1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
OTUB1Q96FW1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
OTUB1Q96FW1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
OTUB1Q96FW1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
OTUB1Q96FW1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
OTUB1Q96FW1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
OTUB1Q96FW1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
OTUB1Q96FW1 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
OTUB1Q96FW1 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
OTUB1Q96FW1 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
OTUB1Q96FW1 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
OTUB1Q96FW1 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
OTUB1Q96FW1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
OTUB1Q96FW1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
OTUB1Q96FW1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
OTUB1Q96FW1 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
OTUB1Q96FW1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
OTUB1Q96FW1 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
OTUB1Q96FW1 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
OTUB1Q96FW1 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
OTUB1Q96FW1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
OTUB1Q96FW1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
OTUB1Q96FW1 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
OTUB1Q96FW1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
OTUB1Q96FW1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
OTUB1Q96FW1 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
OTUB1Q96FW1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
OTUB1Q96FW1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
OTUB1Q96FW1 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
OTUB1Q96FW1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
OTUB1Q96FW1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
OTUB1Q96FW1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
OTUB1Q96FW1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
OTUB1Q96FW1 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
OTUB1Q96FW1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
OTUB1Q96FW1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
OTUB1Q96FW1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
OTUB1Q96FW1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
OTUB1Q96FW1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
OTUB1Q96FW1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
OTUB1Q96FW1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
OTUB1Q96FW1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
OTUB1Q96FW1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
OTUB1Q96FW1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
OTUB1Q96FW1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
OTUB1Q96FW1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
OTUB1Q96FW1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
OTUB1Q96FW1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
OTUB1Q96FW1 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
OTUB1Q96FW1 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
OTUB1Q96FW1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
OTUB1Q96FW1 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
OTUB1Q96FW1 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
OTUB1Q96FW1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
OTUB1Q96FW1 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
OTUB1Q96FW1 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
OTUB1Q96FW1 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
OTUB1Q96FW1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
OTUB1Q96FW1 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
OTUB1Q96FW1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
OTUB1Q96FW1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
OTUB1Q96FW1 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
OTUB1Q96FW1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
OTUB1Q96FW1 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
OTUB1Q96FW1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
OTUB1Q96FW1 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
OTUB1Q96FW1 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
OTUB1Q96FW1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
OTUB1Q96FW1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
OTUB1Q96FW1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
OTUB1Q96FW1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
OTUB1Q96FW1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
OTUB1Q96FW1 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
OTUB1Q96FW1 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
OTUB1Q96FW1 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
OTUB1Q96FW1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
OTUB1Q96FW1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
OTUB1Q96FW1 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
OTUB1Q96FW1 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
OTUB1Q96FW1 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
OTUB1Q96FW1 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
OTUB1Q96FW1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
OTUB1Q96FW1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
OTUB1Q96FW1 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
OTUB1Q96FW1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
OTUB1Q96FW1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms