Protein–RNA interactions for Protein: Q96E22

NUS1, Dehydrodolichyl diphosphate synthase complex subunit NUS1, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUS1Q96E22 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NUS1Q96E22 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUS1Q96E22 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUS1Q96E22 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUS1Q96E22 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUS1Q96E22 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUS1Q96E22 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUS1Q96E22 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUS1Q96E22 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUS1Q96E22 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUS1Q96E22 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUS1Q96E22 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUS1Q96E22 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUS1Q96E22 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
NUS1Q96E22 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUS1Q96E22 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
NUS1Q96E22 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
NUS1Q96E22 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUS1Q96E22 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUS1Q96E22 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUS1Q96E22 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NUS1Q96E22 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUS1Q96E22 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUS1Q96E22 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUS1Q96E22 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
NUS1Q96E22 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUS1Q96E22 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NUS1Q96E22 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NUS1Q96E22 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NUS1Q96E22 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NUS1Q96E22 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NUS1Q96E22 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NUS1Q96E22 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
NUS1Q96E22 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUS1Q96E22 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUS1Q96E22 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUS1Q96E22 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUS1Q96E22 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUS1Q96E22 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUS1Q96E22 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUS1Q96E22 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUS1Q96E22 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUS1Q96E22 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUS1Q96E22 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
NUS1Q96E22 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUS1Q96E22 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUS1Q96E22 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUS1Q96E22 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUS1Q96E22 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUS1Q96E22 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUS1Q96E22 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUS1Q96E22 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUS1Q96E22 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NUS1Q96E22 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
NUS1Q96E22 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NUS1Q96E22 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUS1Q96E22 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUS1Q96E22 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUS1Q96E22 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUS1Q96E22 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUS1Q96E22 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUS1Q96E22 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUS1Q96E22 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUS1Q96E22 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUS1Q96E22 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUS1Q96E22 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
NUS1Q96E22 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUS1Q96E22 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUS1Q96E22 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUS1Q96E22 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUS1Q96E22 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUS1Q96E22 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUS1Q96E22 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUS1Q96E22 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUS1Q96E22 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUS1Q96E22 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUS1Q96E22 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NUS1Q96E22 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NUS1Q96E22 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NUS1Q96E22 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NUS1Q96E22 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUS1Q96E22 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUS1Q96E22 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUS1Q96E22 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUS1Q96E22 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUS1Q96E22 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUS1Q96E22 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUS1Q96E22 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUS1Q96E22 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUS1Q96E22 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUS1Q96E22 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUS1Q96E22 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NUS1Q96E22 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUS1Q96E22 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUS1Q96E22 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUS1Q96E22 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUS1Q96E22 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUS1Q96E22 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NUS1Q96E22 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUS1Q96E22 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms