Protein–RNA interactions for Protein: Q96CP7

TLCD1, Calfacilitin, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLCD1Q96CP7 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TLCD1Q96CP7 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TLCD1Q96CP7 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TLCD1Q96CP7 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TLCD1Q96CP7 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TLCD1Q96CP7 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TLCD1Q96CP7 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TLCD1Q96CP7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TLCD1Q96CP7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TLCD1Q96CP7 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TLCD1Q96CP7 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TLCD1Q96CP7 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TLCD1Q96CP7 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TLCD1Q96CP7 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TLCD1Q96CP7 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TLCD1Q96CP7 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TLCD1Q96CP7 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TLCD1Q96CP7 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TLCD1Q96CP7 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TLCD1Q96CP7 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TLCD1Q96CP7 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TLCD1Q96CP7 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TLCD1Q96CP7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TLCD1Q96CP7 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TLCD1Q96CP7 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TLCD1Q96CP7 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TLCD1Q96CP7 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TLCD1Q96CP7 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TLCD1Q96CP7 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TLCD1Q96CP7 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TLCD1Q96CP7 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TLCD1Q96CP7 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TLCD1Q96CP7 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TLCD1Q96CP7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TLCD1Q96CP7 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TLCD1Q96CP7 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TLCD1Q96CP7 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TLCD1Q96CP7 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TLCD1Q96CP7 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TLCD1Q96CP7 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TLCD1Q96CP7 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TLCD1Q96CP7 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TLCD1Q96CP7 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TLCD1Q96CP7 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TLCD1Q96CP7 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TLCD1Q96CP7 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TLCD1Q96CP7 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TLCD1Q96CP7 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TLCD1Q96CP7 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TLCD1Q96CP7 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TLCD1Q96CP7 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TLCD1Q96CP7 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TLCD1Q96CP7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TLCD1Q96CP7 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TLCD1Q96CP7 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TLCD1Q96CP7 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TLCD1Q96CP7 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TLCD1Q96CP7 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TLCD1Q96CP7 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TLCD1Q96CP7 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TLCD1Q96CP7 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TLCD1Q96CP7 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TLCD1Q96CP7 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TLCD1Q96CP7 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TLCD1Q96CP7 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TLCD1Q96CP7 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TLCD1Q96CP7 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TLCD1Q96CP7 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TLCD1Q96CP7 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TLCD1Q96CP7 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TLCD1Q96CP7 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TLCD1Q96CP7 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TLCD1Q96CP7 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TLCD1Q96CP7 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TLCD1Q96CP7 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TLCD1Q96CP7 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TLCD1Q96CP7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TLCD1Q96CP7 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TLCD1Q96CP7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TLCD1Q96CP7 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TLCD1Q96CP7 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TLCD1Q96CP7 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TLCD1Q96CP7 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TLCD1Q96CP7 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TLCD1Q96CP7 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TLCD1Q96CP7 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TLCD1Q96CP7 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TLCD1Q96CP7 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TLCD1Q96CP7 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TLCD1Q96CP7 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TLCD1Q96CP7 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TLCD1Q96CP7 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TLCD1Q96CP7 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TLCD1Q96CP7 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TLCD1Q96CP7 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TLCD1Q96CP7 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TLCD1Q96CP7 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TLCD1Q96CP7 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TLCD1Q96CP7 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TLCD1Q96CP7 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms