Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ1

FAM3D, Protein FAM3D, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3DQ96BQ1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAM3DQ96BQ1 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAM3DQ96BQ1 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAM3DQ96BQ1 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAM3DQ96BQ1 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAM3DQ96BQ1 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAM3DQ96BQ1 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAM3DQ96BQ1 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
FAM3DQ96BQ1 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAM3DQ96BQ1 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAM3DQ96BQ1 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAM3DQ96BQ1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.83
FAM3DQ96BQ1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM3DQ96BQ1 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM3DQ96BQ1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM3DQ96BQ1 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM3DQ96BQ1 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM3DQ96BQ1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM3DQ96BQ1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM3DQ96BQ1 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM3DQ96BQ1 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM3DQ96BQ1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM3DQ96BQ1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM3DQ96BQ1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM3DQ96BQ1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM3DQ96BQ1 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM3DQ96BQ1 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM3DQ96BQ1 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM3DQ96BQ1 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM3DQ96BQ1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM3DQ96BQ1 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM3DQ96BQ1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM3DQ96BQ1 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM3DQ96BQ1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM3DQ96BQ1 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM3DQ96BQ1 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM3DQ96BQ1 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM3DQ96BQ1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM3DQ96BQ1 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM3DQ96BQ1 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM3DQ96BQ1 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM3DQ96BQ1 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM3DQ96BQ1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM3DQ96BQ1 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM3DQ96BQ1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM3DQ96BQ1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM3DQ96BQ1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM3DQ96BQ1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM3DQ96BQ1 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM3DQ96BQ1 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM3DQ96BQ1 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM3DQ96BQ1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM3DQ96BQ1 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM3DQ96BQ1 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM3DQ96BQ1 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM3DQ96BQ1 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM3DQ96BQ1 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
FAM3DQ96BQ1 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM3DQ96BQ1 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM3DQ96BQ1 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM3DQ96BQ1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM3DQ96BQ1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM3DQ96BQ1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM3DQ96BQ1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM3DQ96BQ1 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM3DQ96BQ1 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM3DQ96BQ1 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM3DQ96BQ1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM3DQ96BQ1 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM3DQ96BQ1 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM3DQ96BQ1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM3DQ96BQ1 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM3DQ96BQ1 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM3DQ96BQ1 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM3DQ96BQ1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM3DQ96BQ1 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM3DQ96BQ1 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM3DQ96BQ1 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM3DQ96BQ1 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM3DQ96BQ1 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM3DQ96BQ1 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM3DQ96BQ1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM3DQ96BQ1 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM3DQ96BQ1 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM3DQ96BQ1 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM3DQ96BQ1 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM3DQ96BQ1 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM3DQ96BQ1 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM3DQ96BQ1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM3DQ96BQ1 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM3DQ96BQ1 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM3DQ96BQ1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM3DQ96BQ1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM3DQ96BQ1 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM3DQ96BQ1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM3DQ96BQ1 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM3DQ96BQ1 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM3DQ96BQ1 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM3DQ96BQ1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM3DQ96BQ1 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
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