Protein–RNA interactions for Protein: Q969I6

SLC38A4, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A4Q969I6 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SLC38A4Q969I6 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SLC38A4Q969I6 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SLC38A4Q969I6 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC38A4Q969I6 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC38A4Q969I6 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC38A4Q969I6 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC38A4Q969I6 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC38A4Q969I6 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC38A4Q969I6 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC38A4Q969I6 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC38A4Q969I6 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC38A4Q969I6 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC38A4Q969I6 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC38A4Q969I6 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC38A4Q969I6 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC38A4Q969I6 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC38A4Q969I6 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC38A4Q969I6 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC38A4Q969I6 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC38A4Q969I6 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC38A4Q969I6 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC38A4Q969I6 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC38A4Q969I6 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC38A4Q969I6 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC38A4Q969I6 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC38A4Q969I6 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC38A4Q969I6 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC38A4Q969I6 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC38A4Q969I6 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC38A4Q969I6 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC38A4Q969I6 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC38A4Q969I6 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC38A4Q969I6 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC38A4Q969I6 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC38A4Q969I6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC38A4Q969I6 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC38A4Q969I6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC38A4Q969I6 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC38A4Q969I6 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC38A4Q969I6 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC38A4Q969I6 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC38A4Q969I6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC38A4Q969I6 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC38A4Q969I6 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC38A4Q969I6 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC38A4Q969I6 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC38A4Q969I6 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC38A4Q969I6 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC38A4Q969I6 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC38A4Q969I6 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC38A4Q969I6 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC38A4Q969I6 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC38A4Q969I6 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
SLC38A4Q969I6 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC38A4Q969I6 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC38A4Q969I6 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC38A4Q969I6 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC38A4Q969I6 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC38A4Q969I6 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC38A4Q969I6 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC38A4Q969I6 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC38A4Q969I6 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC38A4Q969I6 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC38A4Q969I6 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC38A4Q969I6 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC38A4Q969I6 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC38A4Q969I6 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC38A4Q969I6 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC38A4Q969I6 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC38A4Q969I6 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC38A4Q969I6 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC38A4Q969I6 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC38A4Q969I6 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC38A4Q969I6 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC38A4Q969I6 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC38A4Q969I6 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC38A4Q969I6 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC38A4Q969I6 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC38A4Q969I6 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC38A4Q969I6 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC38A4Q969I6 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC38A4Q969I6 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC38A4Q969I6 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC38A4Q969I6 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC38A4Q969I6 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC38A4Q969I6 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC38A4Q969I6 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC38A4Q969I6 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC38A4Q969I6 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC38A4Q969I6 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC38A4Q969I6 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC38A4Q969I6 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC38A4Q969I6 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC38A4Q969I6 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC38A4Q969I6 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC38A4Q969I6 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC38A4Q969I6 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC38A4Q969I6 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC38A4Q969I6 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 347.8 ms