Protein–RNA interactions for Protein: Q92859

NEO1, Neogenin, humanhuman

Predictions only

Length 1,461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEO1Q92859 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
NEO1Q92859 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
NEO1Q92859 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
NEO1Q92859 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
NEO1Q92859 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC36.16■■■■□ 3.38
NEO1Q92859 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
NEO1Q92859 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
NEO1Q92859 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
NEO1Q92859 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
NEO1Q92859 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
NEO1Q92859 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
NEO1Q92859 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
NEO1Q92859 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
NEO1Q92859 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC36.11■■■■□ 3.37
NEO1Q92859 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
NEO1Q92859 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
NEO1Q92859 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
NEO1Q92859 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
NEO1Q92859 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC36.11■■■■□ 3.37
NEO1Q92859 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC36.11■■■■□ 3.37
NEO1Q92859 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
NEO1Q92859 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
NEO1Q92859 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
NEO1Q92859 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
NEO1Q92859 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
NEO1Q92859 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
NEO1Q92859 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
NEO1Q92859 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
NEO1Q92859 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
NEO1Q92859 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
NEO1Q92859 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
NEO1Q92859 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
NEO1Q92859 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
NEO1Q92859 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
NEO1Q92859 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC36.07■■■■□ 3.37
NEO1Q92859 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
NEO1Q92859 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC36.07■■■■□ 3.36
NEO1Q92859 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
NEO1Q92859 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
NEO1Q92859 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
NEO1Q92859 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
NEO1Q92859 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
NEO1Q92859 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
NEO1Q92859 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
NEO1Q92859 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
NEO1Q92859 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
NEO1Q92859 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
NEO1Q92859 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
NEO1Q92859 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
NEO1Q92859 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
NEO1Q92859 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
NEO1Q92859 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
NEO1Q92859 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
NEO1Q92859 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
NEO1Q92859 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
NEO1Q92859 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
NEO1Q92859 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
NEO1Q92859 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
NEO1Q92859 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
NEO1Q92859 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
NEO1Q92859 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
NEO1Q92859 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
NEO1Q92859 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
NEO1Q92859 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
NEO1Q92859 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
NEO1Q92859 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
NEO1Q92859 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
NEO1Q92859 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
NEO1Q92859 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
NEO1Q92859 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
NEO1Q92859 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
NEO1Q92859 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC35.99■■■■□ 3.35
NEO1Q92859 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC35.99■■■■□ 3.35
NEO1Q92859 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC35.99■■■■□ 3.35
NEO1Q92859 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
NEO1Q92859 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC35.99■■■■□ 3.35
NEO1Q92859 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
NEO1Q92859 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
NEO1Q92859 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
NEO1Q92859 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
NEO1Q92859 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
NEO1Q92859 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
NEO1Q92859 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC35.97■■■■□ 3.35
NEO1Q92859 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC35.97■■■■□ 3.35
NEO1Q92859 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
NEO1Q92859 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
NEO1Q92859 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
NEO1Q92859 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
NEO1Q92859 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC35.96■■■■□ 3.35
NEO1Q92859 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
NEO1Q92859 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
NEO1Q92859 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
NEO1Q92859 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
NEO1Q92859 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
NEO1Q92859 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
NEO1Q92859 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
NEO1Q92859 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
NEO1Q92859 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
NEO1Q92859 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
NEO1Q92859 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms