Protein–RNA interactions for Protein: Q92753

RORB, Nuclear receptor ROR-beta, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RORBQ92753 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RORBQ92753 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RORBQ92753 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
RORBQ92753 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RORBQ92753 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RORBQ92753 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RORBQ92753 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RORBQ92753 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RORBQ92753 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RORBQ92753 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RORBQ92753 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RORBQ92753 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RORBQ92753 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RORBQ92753 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RORBQ92753 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RORBQ92753 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RORBQ92753 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RORBQ92753 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RORBQ92753 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RORBQ92753 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RORBQ92753 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RORBQ92753 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RORBQ92753 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RORBQ92753 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RORBQ92753 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RORBQ92753 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RORBQ92753 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RORBQ92753 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RORBQ92753 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RORBQ92753 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RORBQ92753 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RORBQ92753 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RORBQ92753 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RORBQ92753 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RORBQ92753 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RORBQ92753 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RORBQ92753 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RORBQ92753 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RORBQ92753 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RORBQ92753 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RORBQ92753 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RORBQ92753 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RORBQ92753 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RORBQ92753 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RORBQ92753 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RORBQ92753 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RORBQ92753 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RORBQ92753 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RORBQ92753 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RORBQ92753 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RORBQ92753 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RORBQ92753 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RORBQ92753 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RORBQ92753 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RORBQ92753 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RORBQ92753 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RORBQ92753 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RORBQ92753 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RORBQ92753 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RORBQ92753 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RORBQ92753 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RORBQ92753 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RORBQ92753 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RORBQ92753 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RORBQ92753 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RORBQ92753 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RORBQ92753 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RORBQ92753 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RORBQ92753 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
RORBQ92753 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RORBQ92753 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RORBQ92753 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.33■■□□□ 1
RORBQ92753 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RORBQ92753 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
RORBQ92753 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RORBQ92753 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RORBQ92753 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RORBQ92753 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RORBQ92753 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RORBQ92753 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RORBQ92753 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RORBQ92753 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RORBQ92753 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RORBQ92753 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RORBQ92753 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RORBQ92753 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RORBQ92753 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RORBQ92753 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RORBQ92753 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RORBQ92753 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RORBQ92753 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RORBQ92753 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RORBQ92753 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RORBQ92753 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RORBQ92753 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RORBQ92753 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RORBQ92753 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RORBQ92753 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
RORBQ92753 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RORBQ92753 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms