Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXF7

ATL1, Atlastin-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL1Q8WXF7 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ATL1Q8WXF7 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ATL1Q8WXF7 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATL1Q8WXF7 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATL1Q8WXF7 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATL1Q8WXF7 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ATL1Q8WXF7 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ATL1Q8WXF7 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATL1Q8WXF7 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATL1Q8WXF7 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATL1Q8WXF7 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATL1Q8WXF7 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATL1Q8WXF7 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATL1Q8WXF7 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATL1Q8WXF7 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATL1Q8WXF7 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATL1Q8WXF7 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ATL1Q8WXF7 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATL1Q8WXF7 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ATL1Q8WXF7 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ATL1Q8WXF7 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATL1Q8WXF7 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATL1Q8WXF7 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATL1Q8WXF7 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATL1Q8WXF7 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATL1Q8WXF7 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATL1Q8WXF7 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATL1Q8WXF7 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATL1Q8WXF7 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATL1Q8WXF7 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATL1Q8WXF7 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATL1Q8WXF7 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATL1Q8WXF7 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATL1Q8WXF7 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATL1Q8WXF7 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATL1Q8WXF7 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATL1Q8WXF7 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATL1Q8WXF7 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ATL1Q8WXF7 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATL1Q8WXF7 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ATL1Q8WXF7 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ATL1Q8WXF7 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATL1Q8WXF7 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATL1Q8WXF7 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATL1Q8WXF7 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATL1Q8WXF7 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATL1Q8WXF7 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATL1Q8WXF7 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATL1Q8WXF7 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ATL1Q8WXF7 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATL1Q8WXF7 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATL1Q8WXF7 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATL1Q8WXF7 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATL1Q8WXF7 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATL1Q8WXF7 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATL1Q8WXF7 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATL1Q8WXF7 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ATL1Q8WXF7 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATL1Q8WXF7 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATL1Q8WXF7 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATL1Q8WXF7 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATL1Q8WXF7 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATL1Q8WXF7 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATL1Q8WXF7 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATL1Q8WXF7 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATL1Q8WXF7 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ATL1Q8WXF7 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATL1Q8WXF7 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATL1Q8WXF7 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATL1Q8WXF7 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATL1Q8WXF7 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ATL1Q8WXF7 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATL1Q8WXF7 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATL1Q8WXF7 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATL1Q8WXF7 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATL1Q8WXF7 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATL1Q8WXF7 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATL1Q8WXF7 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATL1Q8WXF7 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATL1Q8WXF7 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATL1Q8WXF7 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATL1Q8WXF7 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATL1Q8WXF7 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATL1Q8WXF7 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ATL1Q8WXF7 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATL1Q8WXF7 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATL1Q8WXF7 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATL1Q8WXF7 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATL1Q8WXF7 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATL1Q8WXF7 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATL1Q8WXF7 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATL1Q8WXF7 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATL1Q8WXF7 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATL1Q8WXF7 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATL1Q8WXF7 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATL1Q8WXF7 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATL1Q8WXF7 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATL1Q8WXF7 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATL1Q8WXF7 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATL1Q8WXF7 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms