Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH9

ATL2, Atlastin-2, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL2Q8NHH9 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ATL2Q8NHH9 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATL2Q8NHH9 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ATL2Q8NHH9 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATL2Q8NHH9 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATL2Q8NHH9 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATL2Q8NHH9 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATL2Q8NHH9 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATL2Q8NHH9 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATL2Q8NHH9 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATL2Q8NHH9 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATL2Q8NHH9 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATL2Q8NHH9 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATL2Q8NHH9 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATL2Q8NHH9 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ATL2Q8NHH9 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATL2Q8NHH9 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATL2Q8NHH9 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATL2Q8NHH9 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATL2Q8NHH9 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATL2Q8NHH9 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATL2Q8NHH9 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATL2Q8NHH9 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATL2Q8NHH9 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATL2Q8NHH9 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATL2Q8NHH9 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATL2Q8NHH9 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATL2Q8NHH9 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATL2Q8NHH9 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATL2Q8NHH9 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATL2Q8NHH9 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATL2Q8NHH9 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ATL2Q8NHH9 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATL2Q8NHH9 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATL2Q8NHH9 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATL2Q8NHH9 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATL2Q8NHH9 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATL2Q8NHH9 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ATL2Q8NHH9 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATL2Q8NHH9 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATL2Q8NHH9 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATL2Q8NHH9 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATL2Q8NHH9 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATL2Q8NHH9 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATL2Q8NHH9 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATL2Q8NHH9 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATL2Q8NHH9 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATL2Q8NHH9 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATL2Q8NHH9 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATL2Q8NHH9 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATL2Q8NHH9 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATL2Q8NHH9 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATL2Q8NHH9 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ATL2Q8NHH9 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ATL2Q8NHH9 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ATL2Q8NHH9 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATL2Q8NHH9 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATL2Q8NHH9 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATL2Q8NHH9 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATL2Q8NHH9 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATL2Q8NHH9 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATL2Q8NHH9 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATL2Q8NHH9 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATL2Q8NHH9 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATL2Q8NHH9 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATL2Q8NHH9 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATL2Q8NHH9 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATL2Q8NHH9 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATL2Q8NHH9 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATL2Q8NHH9 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATL2Q8NHH9 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATL2Q8NHH9 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ATL2Q8NHH9 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ATL2Q8NHH9 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ATL2Q8NHH9 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATL2Q8NHH9 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATL2Q8NHH9 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATL2Q8NHH9 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ATL2Q8NHH9 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ATL2Q8NHH9 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ATL2Q8NHH9 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATL2Q8NHH9 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATL2Q8NHH9 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATL2Q8NHH9 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATL2Q8NHH9 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATL2Q8NHH9 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATL2Q8NHH9 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATL2Q8NHH9 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATL2Q8NHH9 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ATL2Q8NHH9 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATL2Q8NHH9 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATL2Q8NHH9 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATL2Q8NHH9 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATL2Q8NHH9 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATL2Q8NHH9 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATL2Q8NHH9 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATL2Q8NHH9 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATL2Q8NHH9 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATL2Q8NHH9 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATL2Q8NHH9 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.8 ms