Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEY3

SPATA4, Spermatogenesis-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA4Q8NEY3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SPATA4Q8NEY3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPATA4Q8NEY3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPATA4Q8NEY3 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPATA4Q8NEY3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPATA4Q8NEY3 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPATA4Q8NEY3 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPATA4Q8NEY3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPATA4Q8NEY3 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPATA4Q8NEY3 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPATA4Q8NEY3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPATA4Q8NEY3 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPATA4Q8NEY3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPATA4Q8NEY3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPATA4Q8NEY3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SPATA4Q8NEY3 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPATA4Q8NEY3 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPATA4Q8NEY3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPATA4Q8NEY3 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPATA4Q8NEY3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPATA4Q8NEY3 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPATA4Q8NEY3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPATA4Q8NEY3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPATA4Q8NEY3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPATA4Q8NEY3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPATA4Q8NEY3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPATA4Q8NEY3 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPATA4Q8NEY3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPATA4Q8NEY3 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPATA4Q8NEY3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPATA4Q8NEY3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPATA4Q8NEY3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPATA4Q8NEY3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPATA4Q8NEY3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPATA4Q8NEY3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPATA4Q8NEY3 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPATA4Q8NEY3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPATA4Q8NEY3 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPATA4Q8NEY3 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPATA4Q8NEY3 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPATA4Q8NEY3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPATA4Q8NEY3 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPATA4Q8NEY3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPATA4Q8NEY3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPATA4Q8NEY3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SPATA4Q8NEY3 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPATA4Q8NEY3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPATA4Q8NEY3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPATA4Q8NEY3 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPATA4Q8NEY3 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPATA4Q8NEY3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPATA4Q8NEY3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPATA4Q8NEY3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPATA4Q8NEY3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPATA4Q8NEY3 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPATA4Q8NEY3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPATA4Q8NEY3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPATA4Q8NEY3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPATA4Q8NEY3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPATA4Q8NEY3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPATA4Q8NEY3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPATA4Q8NEY3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPATA4Q8NEY3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPATA4Q8NEY3 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPATA4Q8NEY3 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPATA4Q8NEY3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPATA4Q8NEY3 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPATA4Q8NEY3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPATA4Q8NEY3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPATA4Q8NEY3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPATA4Q8NEY3 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPATA4Q8NEY3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPATA4Q8NEY3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPATA4Q8NEY3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPATA4Q8NEY3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPATA4Q8NEY3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPATA4Q8NEY3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPATA4Q8NEY3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPATA4Q8NEY3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPATA4Q8NEY3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPATA4Q8NEY3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPATA4Q8NEY3 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPATA4Q8NEY3 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPATA4Q8NEY3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPATA4Q8NEY3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPATA4Q8NEY3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPATA4Q8NEY3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPATA4Q8NEY3 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPATA4Q8NEY3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPATA4Q8NEY3 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPATA4Q8NEY3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPATA4Q8NEY3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPATA4Q8NEY3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPATA4Q8NEY3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPATA4Q8NEY3 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPATA4Q8NEY3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPATA4Q8NEY3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPATA4Q8NEY3 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPATA4Q8NEY3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPATA4Q8NEY3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms