Protein–RNA interactions for Protein: Q8IY92

SLX4, Structure-specific endonuclease subunit SLX4, humanhuman

Predictions only

Length 1,834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLX4Q8IY92 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SLX4Q8IY92 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SLX4Q8IY92 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SLX4Q8IY92 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SLX4Q8IY92 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SLX4Q8IY92 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SLX4Q8IY92 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SLX4Q8IY92 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SLX4Q8IY92 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SLX4Q8IY92 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SLX4Q8IY92 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
SLX4Q8IY92 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SLX4Q8IY92 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SLX4Q8IY92 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SLX4Q8IY92 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SLX4Q8IY92 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SLX4Q8IY92 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SLX4Q8IY92 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SLX4Q8IY92 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SLX4Q8IY92 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
SLX4Q8IY92 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SLX4Q8IY92 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SLX4Q8IY92 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SLX4Q8IY92 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
SLX4Q8IY92 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SLX4Q8IY92 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SLX4Q8IY92 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SLX4Q8IY92 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SLX4Q8IY92 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SLX4Q8IY92 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SLX4Q8IY92 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SLX4Q8IY92 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SLX4Q8IY92 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SLX4Q8IY92 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SLX4Q8IY92 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SLX4Q8IY92 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
SLX4Q8IY92 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SLX4Q8IY92 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SLX4Q8IY92 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SLX4Q8IY92 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SLX4Q8IY92 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
SLX4Q8IY92 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SLX4Q8IY92 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SLX4Q8IY92 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
SLX4Q8IY92 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SLX4Q8IY92 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SLX4Q8IY92 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SLX4Q8IY92 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SLX4Q8IY92 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
SLX4Q8IY92 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SLX4Q8IY92 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SLX4Q8IY92 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SLX4Q8IY92 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SLX4Q8IY92 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
SLX4Q8IY92 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SLX4Q8IY92 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SLX4Q8IY92 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SLX4Q8IY92 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SLX4Q8IY92 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SLX4Q8IY92 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SLX4Q8IY92 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SLX4Q8IY92 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SLX4Q8IY92 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SLX4Q8IY92 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SLX4Q8IY92 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SLX4Q8IY92 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SLX4Q8IY92 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SLX4Q8IY92 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SLX4Q8IY92 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SLX4Q8IY92 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SLX4Q8IY92 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SLX4Q8IY92 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SLX4Q8IY92 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SLX4Q8IY92 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
SLX4Q8IY92 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SLX4Q8IY92 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SLX4Q8IY92 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SLX4Q8IY92 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SLX4Q8IY92 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SLX4Q8IY92 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SLX4Q8IY92 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SLX4Q8IY92 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SLX4Q8IY92 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SLX4Q8IY92 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
SLX4Q8IY92 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SLX4Q8IY92 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
SLX4Q8IY92 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SLX4Q8IY92 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
SLX4Q8IY92 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
SLX4Q8IY92 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SLX4Q8IY92 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
SLX4Q8IY92 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SLX4Q8IY92 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SLX4Q8IY92 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
SLX4Q8IY92 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
SLX4Q8IY92 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SLX4Q8IY92 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SLX4Q8IY92 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
SLX4Q8IY92 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SLX4Q8IY92 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms