Protein–RNA interactions for Protein: Q76NI1

KNDC1, Protein very KIND, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNDC1Q76NI1 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
KNDC1Q76NI1 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
KNDC1Q76NI1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
KNDC1Q76NI1 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
KNDC1Q76NI1 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
KNDC1Q76NI1 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
KNDC1Q76NI1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
KNDC1Q76NI1 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
KNDC1Q76NI1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
KNDC1Q76NI1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
KNDC1Q76NI1 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC33.14■■■□□ 2.89
KNDC1Q76NI1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
KNDC1Q76NI1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
KNDC1Q76NI1 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
KNDC1Q76NI1 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
KNDC1Q76NI1 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
KNDC1Q76NI1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
KNDC1Q76NI1 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
KNDC1Q76NI1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
KNDC1Q76NI1 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
KNDC1Q76NI1 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
KNDC1Q76NI1 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
KNDC1Q76NI1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
KNDC1Q76NI1 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
KNDC1Q76NI1 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
KNDC1Q76NI1 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
KNDC1Q76NI1 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC33.1■■■□□ 2.89
KNDC1Q76NI1 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
KNDC1Q76NI1 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
KNDC1Q76NI1 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
KNDC1Q76NI1 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC33.09■■■□□ 2.89
KNDC1Q76NI1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
KNDC1Q76NI1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
KNDC1Q76NI1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
KNDC1Q76NI1 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
KNDC1Q76NI1 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
KNDC1Q76NI1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
KNDC1Q76NI1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
KNDC1Q76NI1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
KNDC1Q76NI1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
KNDC1Q76NI1 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
KNDC1Q76NI1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.89
KNDC1Q76NI1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
KNDC1Q76NI1 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
KNDC1Q76NI1 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
KNDC1Q76NI1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
KNDC1Q76NI1 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC33.06■■■□□ 2.88
KNDC1Q76NI1 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
KNDC1Q76NI1 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
KNDC1Q76NI1 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
KNDC1Q76NI1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
KNDC1Q76NI1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
KNDC1Q76NI1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
KNDC1Q76NI1 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
KNDC1Q76NI1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
KNDC1Q76NI1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
KNDC1Q76NI1 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC33.04■■■□□ 2.88
KNDC1Q76NI1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
KNDC1Q76NI1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
KNDC1Q76NI1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
KNDC1Q76NI1 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
KNDC1Q76NI1 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
KNDC1Q76NI1 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
KNDC1Q76NI1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
KNDC1Q76NI1 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
KNDC1Q76NI1 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
KNDC1Q76NI1 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
KNDC1Q76NI1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
KNDC1Q76NI1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.88
KNDC1Q76NI1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
KNDC1Q76NI1 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
KNDC1Q76NI1 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
KNDC1Q76NI1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
KNDC1Q76NI1 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
KNDC1Q76NI1 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC33■■■□□ 2.87
KNDC1Q76NI1 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
KNDC1Q76NI1 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
KNDC1Q76NI1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
KNDC1Q76NI1 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC32.99■■■□□ 2.87
KNDC1Q76NI1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
KNDC1Q76NI1 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
KNDC1Q76NI1 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
KNDC1Q76NI1 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
KNDC1Q76NI1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
KNDC1Q76NI1 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
KNDC1Q76NI1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
KNDC1Q76NI1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
KNDC1Q76NI1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
KNDC1Q76NI1 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
KNDC1Q76NI1 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
KNDC1Q76NI1 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
KNDC1Q76NI1 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
KNDC1Q76NI1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
KNDC1Q76NI1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
KNDC1Q76NI1 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
KNDC1Q76NI1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC32.96■■■□□ 2.87
KNDC1Q76NI1 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
KNDC1Q76NI1 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
KNDC1Q76NI1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC32.96■■■□□ 2.87
KNDC1Q76NI1 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms