Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWH5

NEK10, Serine/threonine-protein kinase Nek10, humanhuman

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK10Q6ZWH5 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEK10Q6ZWH5 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEK10Q6ZWH5 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEK10Q6ZWH5 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEK10Q6ZWH5 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEK10Q6ZWH5 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEK10Q6ZWH5 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NEK10Q6ZWH5 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEK10Q6ZWH5 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEK10Q6ZWH5 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEK10Q6ZWH5 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEK10Q6ZWH5 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEK10Q6ZWH5 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEK10Q6ZWH5 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEK10Q6ZWH5 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEK10Q6ZWH5 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEK10Q6ZWH5 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEK10Q6ZWH5 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
NEK10Q6ZWH5 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
NEK10Q6ZWH5 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEK10Q6ZWH5 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEK10Q6ZWH5 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEK10Q6ZWH5 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEK10Q6ZWH5 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEK10Q6ZWH5 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEK10Q6ZWH5 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEK10Q6ZWH5 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEK10Q6ZWH5 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEK10Q6ZWH5 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEK10Q6ZWH5 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEK10Q6ZWH5 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEK10Q6ZWH5 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEK10Q6ZWH5 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEK10Q6ZWH5 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEK10Q6ZWH5 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEK10Q6ZWH5 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NEK10Q6ZWH5 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NEK10Q6ZWH5 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NEK10Q6ZWH5 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NEK10Q6ZWH5 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NEK10Q6ZWH5 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
NEK10Q6ZWH5 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NEK10Q6ZWH5 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NEK10Q6ZWH5 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NEK10Q6ZWH5 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NEK10Q6ZWH5 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEK10Q6ZWH5 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEK10Q6ZWH5 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEK10Q6ZWH5 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEK10Q6ZWH5 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEK10Q6ZWH5 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEK10Q6ZWH5 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEK10Q6ZWH5 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEK10Q6ZWH5 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEK10Q6ZWH5 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEK10Q6ZWH5 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEK10Q6ZWH5 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
NEK10Q6ZWH5 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEK10Q6ZWH5 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEK10Q6ZWH5 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEK10Q6ZWH5 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEK10Q6ZWH5 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEK10Q6ZWH5 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEK10Q6ZWH5 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEK10Q6ZWH5 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NEK10Q6ZWH5 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEK10Q6ZWH5 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEK10Q6ZWH5 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEK10Q6ZWH5 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEK10Q6ZWH5 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEK10Q6ZWH5 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEK10Q6ZWH5 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEK10Q6ZWH5 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEK10Q6ZWH5 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEK10Q6ZWH5 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEK10Q6ZWH5 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEK10Q6ZWH5 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEK10Q6ZWH5 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEK10Q6ZWH5 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEK10Q6ZWH5 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEK10Q6ZWH5 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEK10Q6ZWH5 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEK10Q6ZWH5 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEK10Q6ZWH5 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NEK10Q6ZWH5 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEK10Q6ZWH5 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEK10Q6ZWH5 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEK10Q6ZWH5 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEK10Q6ZWH5 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEK10Q6ZWH5 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEK10Q6ZWH5 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEK10Q6ZWH5 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
NEK10Q6ZWH5 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEK10Q6ZWH5 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEK10Q6ZWH5 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEK10Q6ZWH5 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEK10Q6ZWH5 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEK10Q6ZWH5 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEK10Q6ZWH5 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEK10Q6ZWH5 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms