Protein–RNA interactions for Protein: Q6WBX8

RAD9B, Cell cycle checkpoint control protein RAD9B, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD9BQ6WBX8 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAD9BQ6WBX8 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
RAD9BQ6WBX8 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAD9BQ6WBX8 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAD9BQ6WBX8 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAD9BQ6WBX8 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAD9BQ6WBX8 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAD9BQ6WBX8 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAD9BQ6WBX8 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAD9BQ6WBX8 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAD9BQ6WBX8 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAD9BQ6WBX8 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAD9BQ6WBX8 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAD9BQ6WBX8 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAD9BQ6WBX8 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAD9BQ6WBX8 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAD9BQ6WBX8 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAD9BQ6WBX8 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAD9BQ6WBX8 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
RAD9BQ6WBX8 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAD9BQ6WBX8 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAD9BQ6WBX8 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAD9BQ6WBX8 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAD9BQ6WBX8 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAD9BQ6WBX8 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAD9BQ6WBX8 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAD9BQ6WBX8 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAD9BQ6WBX8 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAD9BQ6WBX8 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAD9BQ6WBX8 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAD9BQ6WBX8 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAD9BQ6WBX8 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAD9BQ6WBX8 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAD9BQ6WBX8 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAD9BQ6WBX8 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAD9BQ6WBX8 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAD9BQ6WBX8 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAD9BQ6WBX8 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAD9BQ6WBX8 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAD9BQ6WBX8 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RAD9BQ6WBX8 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RAD9BQ6WBX8 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RAD9BQ6WBX8 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RAD9BQ6WBX8 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RAD9BQ6WBX8 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RAD9BQ6WBX8 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RAD9BQ6WBX8 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RAD9BQ6WBX8 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RAD9BQ6WBX8 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RAD9BQ6WBX8 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAD9BQ6WBX8 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAD9BQ6WBX8 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAD9BQ6WBX8 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAD9BQ6WBX8 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAD9BQ6WBX8 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
RAD9BQ6WBX8 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
RAD9BQ6WBX8 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAD9BQ6WBX8 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAD9BQ6WBX8 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAD9BQ6WBX8 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAD9BQ6WBX8 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAD9BQ6WBX8 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAD9BQ6WBX8 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAD9BQ6WBX8 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAD9BQ6WBX8 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAD9BQ6WBX8 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAD9BQ6WBX8 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAD9BQ6WBX8 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAD9BQ6WBX8 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
RAD9BQ6WBX8 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAD9BQ6WBX8 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
RAD9BQ6WBX8 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAD9BQ6WBX8 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAD9BQ6WBX8 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAD9BQ6WBX8 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAD9BQ6WBX8 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAD9BQ6WBX8 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAD9BQ6WBX8 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAD9BQ6WBX8 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
RAD9BQ6WBX8 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAD9BQ6WBX8 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
RAD9BQ6WBX8 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAD9BQ6WBX8 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAD9BQ6WBX8 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAD9BQ6WBX8 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAD9BQ6WBX8 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAD9BQ6WBX8 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAD9BQ6WBX8 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAD9BQ6WBX8 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAD9BQ6WBX8 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAD9BQ6WBX8 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAD9BQ6WBX8 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAD9BQ6WBX8 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAD9BQ6WBX8 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAD9BQ6WBX8 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAD9BQ6WBX8 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAD9BQ6WBX8 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAD9BQ6WBX8 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAD9BQ6WBX8 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
RAD9BQ6WBX8 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms