Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIL6

KCNIP4, Kv channel-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP4Q6PIL6 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNIP4Q6PIL6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNIP4Q6PIL6 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNIP4Q6PIL6 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNIP4Q6PIL6 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNIP4Q6PIL6 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNIP4Q6PIL6 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNIP4Q6PIL6 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNIP4Q6PIL6 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNIP4Q6PIL6 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNIP4Q6PIL6 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNIP4Q6PIL6 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNIP4Q6PIL6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNIP4Q6PIL6 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNIP4Q6PIL6 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNIP4Q6PIL6 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNIP4Q6PIL6 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNIP4Q6PIL6 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNIP4Q6PIL6 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNIP4Q6PIL6 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNIP4Q6PIL6 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNIP4Q6PIL6 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNIP4Q6PIL6 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNIP4Q6PIL6 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNIP4Q6PIL6 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNIP4Q6PIL6 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNIP4Q6PIL6 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNIP4Q6PIL6 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNIP4Q6PIL6 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNIP4Q6PIL6 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNIP4Q6PIL6 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNIP4Q6PIL6 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNIP4Q6PIL6 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNIP4Q6PIL6 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNIP4Q6PIL6 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNIP4Q6PIL6 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KCNIP4Q6PIL6 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNIP4Q6PIL6 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNIP4Q6PIL6 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNIP4Q6PIL6 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNIP4Q6PIL6 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNIP4Q6PIL6 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNIP4Q6PIL6 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNIP4Q6PIL6 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNIP4Q6PIL6 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNIP4Q6PIL6 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNIP4Q6PIL6 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNIP4Q6PIL6 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNIP4Q6PIL6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNIP4Q6PIL6 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNIP4Q6PIL6 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNIP4Q6PIL6 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNIP4Q6PIL6 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNIP4Q6PIL6 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNIP4Q6PIL6 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNIP4Q6PIL6 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNIP4Q6PIL6 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNIP4Q6PIL6 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNIP4Q6PIL6 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNIP4Q6PIL6 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNIP4Q6PIL6 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNIP4Q6PIL6 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNIP4Q6PIL6 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNIP4Q6PIL6 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNIP4Q6PIL6 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNIP4Q6PIL6 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNIP4Q6PIL6 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNIP4Q6PIL6 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNIP4Q6PIL6 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNIP4Q6PIL6 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNIP4Q6PIL6 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNIP4Q6PIL6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNIP4Q6PIL6 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNIP4Q6PIL6 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNIP4Q6PIL6 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNIP4Q6PIL6 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNIP4Q6PIL6 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNIP4Q6PIL6 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNIP4Q6PIL6 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNIP4Q6PIL6 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNIP4Q6PIL6 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNIP4Q6PIL6 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNIP4Q6PIL6 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNIP4Q6PIL6 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNIP4Q6PIL6 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNIP4Q6PIL6 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNIP4Q6PIL6 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNIP4Q6PIL6 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNIP4Q6PIL6 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNIP4Q6PIL6 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNIP4Q6PIL6 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNIP4Q6PIL6 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNIP4Q6PIL6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNIP4Q6PIL6 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNIP4Q6PIL6 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNIP4Q6PIL6 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNIP4Q6PIL6 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNIP4Q6PIL6 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNIP4Q6PIL6 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNIP4Q6PIL6 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms