Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW7

NANOGP8, Putative homeobox protein NANOGP8, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP8Q6NSW7 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NANOGP8Q6NSW7 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NANOGP8Q6NSW7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NANOGP8Q6NSW7 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NANOGP8Q6NSW7 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NANOGP8Q6NSW7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NANOGP8Q6NSW7 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NANOGP8Q6NSW7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NANOGP8Q6NSW7 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NANOGP8Q6NSW7 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NANOGP8Q6NSW7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NANOGP8Q6NSW7 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NANOGP8Q6NSW7 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NANOGP8Q6NSW7 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NANOGP8Q6NSW7 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NANOGP8Q6NSW7 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NANOGP8Q6NSW7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NANOGP8Q6NSW7 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NANOGP8Q6NSW7 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NANOGP8Q6NSW7 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NANOGP8Q6NSW7 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NANOGP8Q6NSW7 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NANOGP8Q6NSW7 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NANOGP8Q6NSW7 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NANOGP8Q6NSW7 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NANOGP8Q6NSW7 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NANOGP8Q6NSW7 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NANOGP8Q6NSW7 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NANOGP8Q6NSW7 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NANOGP8Q6NSW7 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NANOGP8Q6NSW7 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NANOGP8Q6NSW7 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NANOGP8Q6NSW7 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NANOGP8Q6NSW7 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NANOGP8Q6NSW7 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NANOGP8Q6NSW7 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NANOGP8Q6NSW7 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NANOGP8Q6NSW7 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NANOGP8Q6NSW7 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NANOGP8Q6NSW7 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NANOGP8Q6NSW7 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NANOGP8Q6NSW7 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NANOGP8Q6NSW7 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NANOGP8Q6NSW7 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NANOGP8Q6NSW7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NANOGP8Q6NSW7 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NANOGP8Q6NSW7 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NANOGP8Q6NSW7 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NANOGP8Q6NSW7 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NANOGP8Q6NSW7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NANOGP8Q6NSW7 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NANOGP8Q6NSW7 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NANOGP8Q6NSW7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NANOGP8Q6NSW7 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NANOGP8Q6NSW7 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NANOGP8Q6NSW7 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NANOGP8Q6NSW7 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NANOGP8Q6NSW7 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NANOGP8Q6NSW7 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NANOGP8Q6NSW7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NANOGP8Q6NSW7 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NANOGP8Q6NSW7 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NANOGP8Q6NSW7 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NANOGP8Q6NSW7 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NANOGP8Q6NSW7 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NANOGP8Q6NSW7 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NANOGP8Q6NSW7 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NANOGP8Q6NSW7 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NANOGP8Q6NSW7 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NANOGP8Q6NSW7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NANOGP8Q6NSW7 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NANOGP8Q6NSW7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NANOGP8Q6NSW7 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NANOGP8Q6NSW7 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NANOGP8Q6NSW7 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NANOGP8Q6NSW7 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NANOGP8Q6NSW7 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NANOGP8Q6NSW7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NANOGP8Q6NSW7 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NANOGP8Q6NSW7 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NANOGP8Q6NSW7 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NANOGP8Q6NSW7 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NANOGP8Q6NSW7 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NANOGP8Q6NSW7 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NANOGP8Q6NSW7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NANOGP8Q6NSW7 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NANOGP8Q6NSW7 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NANOGP8Q6NSW7 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NANOGP8Q6NSW7 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NANOGP8Q6NSW7 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NANOGP8Q6NSW7 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NANOGP8Q6NSW7 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NANOGP8Q6NSW7 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NANOGP8Q6NSW7 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NANOGP8Q6NSW7 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NANOGP8Q6NSW7 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NANOGP8Q6NSW7 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NANOGP8Q6NSW7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NANOGP8Q6NSW7 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NANOGP8Q6NSW7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms