Protein–RNA interactions for Protein: Q68J44

DUPD1, Dual specificity phosphatase DUPD1, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUPD1Q68J44 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DUPD1Q68J44 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DUPD1Q68J44 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DUPD1Q68J44 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DUPD1Q68J44 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
DUPD1Q68J44 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
DUPD1Q68J44 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DUPD1Q68J44 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DUPD1Q68J44 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DUPD1Q68J44 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DUPD1Q68J44 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DUPD1Q68J44 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DUPD1Q68J44 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DUPD1Q68J44 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DUPD1Q68J44 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DUPD1Q68J44 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DUPD1Q68J44 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DUPD1Q68J44 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DUPD1Q68J44 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DUPD1Q68J44 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DUPD1Q68J44 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DUPD1Q68J44 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DUPD1Q68J44 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DUPD1Q68J44 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DUPD1Q68J44 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DUPD1Q68J44 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DUPD1Q68J44 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DUPD1Q68J44 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DUPD1Q68J44 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DUPD1Q68J44 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DUPD1Q68J44 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DUPD1Q68J44 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DUPD1Q68J44 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DUPD1Q68J44 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DUPD1Q68J44 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DUPD1Q68J44 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DUPD1Q68J44 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DUPD1Q68J44 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DUPD1Q68J44 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DUPD1Q68J44 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DUPD1Q68J44 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DUPD1Q68J44 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DUPD1Q68J44 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DUPD1Q68J44 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
DUPD1Q68J44 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DUPD1Q68J44 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DUPD1Q68J44 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DUPD1Q68J44 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DUPD1Q68J44 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DUPD1Q68J44 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
DUPD1Q68J44 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DUPD1Q68J44 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DUPD1Q68J44 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DUPD1Q68J44 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DUPD1Q68J44 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DUPD1Q68J44 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DUPD1Q68J44 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DUPD1Q68J44 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DUPD1Q68J44 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DUPD1Q68J44 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DUPD1Q68J44 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DUPD1Q68J44 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DUPD1Q68J44 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DUPD1Q68J44 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DUPD1Q68J44 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DUPD1Q68J44 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DUPD1Q68J44 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DUPD1Q68J44 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DUPD1Q68J44 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
DUPD1Q68J44 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DUPD1Q68J44 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DUPD1Q68J44 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DUPD1Q68J44 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DUPD1Q68J44 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DUPD1Q68J44 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DUPD1Q68J44 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DUPD1Q68J44 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DUPD1Q68J44 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DUPD1Q68J44 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DUPD1Q68J44 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DUPD1Q68J44 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
DUPD1Q68J44 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DUPD1Q68J44 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DUPD1Q68J44 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DUPD1Q68J44 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DUPD1Q68J44 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DUPD1Q68J44 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DUPD1Q68J44 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DUPD1Q68J44 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
DUPD1Q68J44 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
DUPD1Q68J44 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DUPD1Q68J44 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DUPD1Q68J44 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DUPD1Q68J44 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DUPD1Q68J44 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DUPD1Q68J44 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
DUPD1Q68J44 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DUPD1Q68J44 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DUPD1Q68J44 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DUPD1Q68J44 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms