Protein–RNA interactions for Protein: Q66K66

TMEM198, Transmembrane protein 198, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM198Q66K66 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM198Q66K66 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM198Q66K66 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM198Q66K66 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM198Q66K66 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM198Q66K66 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM198Q66K66 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM198Q66K66 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM198Q66K66 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM198Q66K66 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM198Q66K66 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM198Q66K66 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM198Q66K66 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TMEM198Q66K66 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TMEM198Q66K66 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TMEM198Q66K66 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TMEM198Q66K66 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TMEM198Q66K66 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM198Q66K66 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM198Q66K66 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM198Q66K66 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM198Q66K66 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM198Q66K66 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM198Q66K66 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM198Q66K66 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM198Q66K66 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM198Q66K66 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM198Q66K66 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM198Q66K66 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM198Q66K66 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM198Q66K66 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM198Q66K66 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM198Q66K66 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM198Q66K66 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM198Q66K66 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM198Q66K66 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM198Q66K66 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM198Q66K66 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM198Q66K66 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM198Q66K66 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM198Q66K66 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM198Q66K66 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM198Q66K66 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM198Q66K66 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM198Q66K66 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM198Q66K66 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM198Q66K66 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM198Q66K66 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM198Q66K66 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM198Q66K66 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM198Q66K66 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM198Q66K66 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM198Q66K66 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM198Q66K66 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM198Q66K66 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM198Q66K66 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM198Q66K66 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM198Q66K66 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM198Q66K66 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM198Q66K66 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM198Q66K66 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM198Q66K66 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM198Q66K66 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM198Q66K66 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM198Q66K66 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
TMEM198Q66K66 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM198Q66K66 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM198Q66K66 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM198Q66K66 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM198Q66K66 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM198Q66K66 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM198Q66K66 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM198Q66K66 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM198Q66K66 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM198Q66K66 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM198Q66K66 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM198Q66K66 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM198Q66K66 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM198Q66K66 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM198Q66K66 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM198Q66K66 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM198Q66K66 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM198Q66K66 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM198Q66K66 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM198Q66K66 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM198Q66K66 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM198Q66K66 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM198Q66K66 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM198Q66K66 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM198Q66K66 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM198Q66K66 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM198Q66K66 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM198Q66K66 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM198Q66K66 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM198Q66K66 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM198Q66K66 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM198Q66K66 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM198Q66K66 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM198Q66K66 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM198Q66K66 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms