Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0N0

C9orf57, Uncharacterized protein C9orf57, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf57Q5W0N0 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
C9orf57Q5W0N0 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
C9orf57Q5W0N0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
C9orf57Q5W0N0 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
C9orf57Q5W0N0 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
C9orf57Q5W0N0 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
C9orf57Q5W0N0 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
C9orf57Q5W0N0 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
C9orf57Q5W0N0 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
C9orf57Q5W0N0 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
C9orf57Q5W0N0 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
C9orf57Q5W0N0 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
C9orf57Q5W0N0 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
C9orf57Q5W0N0 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
C9orf57Q5W0N0 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
C9orf57Q5W0N0 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
C9orf57Q5W0N0 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
C9orf57Q5W0N0 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
C9orf57Q5W0N0 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
C9orf57Q5W0N0 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
C9orf57Q5W0N0 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C9orf57Q5W0N0 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
C9orf57Q5W0N0 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
C9orf57Q5W0N0 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
C9orf57Q5W0N0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
C9orf57Q5W0N0 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
C9orf57Q5W0N0 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C9orf57Q5W0N0 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
C9orf57Q5W0N0 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
C9orf57Q5W0N0 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
C9orf57Q5W0N0 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
C9orf57Q5W0N0 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
C9orf57Q5W0N0 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
C9orf57Q5W0N0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
C9orf57Q5W0N0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
C9orf57Q5W0N0 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
C9orf57Q5W0N0 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
C9orf57Q5W0N0 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
C9orf57Q5W0N0 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
C9orf57Q5W0N0 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
C9orf57Q5W0N0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
C9orf57Q5W0N0 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C9orf57Q5W0N0 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
C9orf57Q5W0N0 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
C9orf57Q5W0N0 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
C9orf57Q5W0N0 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C9orf57Q5W0N0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C9orf57Q5W0N0 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
C9orf57Q5W0N0 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
C9orf57Q5W0N0 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
C9orf57Q5W0N0 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
C9orf57Q5W0N0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
C9orf57Q5W0N0 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
C9orf57Q5W0N0 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
C9orf57Q5W0N0 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
C9orf57Q5W0N0 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
C9orf57Q5W0N0 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
C9orf57Q5W0N0 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
C9orf57Q5W0N0 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
C9orf57Q5W0N0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
C9orf57Q5W0N0 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
C9orf57Q5W0N0 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
C9orf57Q5W0N0 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
C9orf57Q5W0N0 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
C9orf57Q5W0N0 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
C9orf57Q5W0N0 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
C9orf57Q5W0N0 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
C9orf57Q5W0N0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
C9orf57Q5W0N0 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
C9orf57Q5W0N0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
C9orf57Q5W0N0 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
C9orf57Q5W0N0 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
C9orf57Q5W0N0 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
C9orf57Q5W0N0 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
C9orf57Q5W0N0 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
C9orf57Q5W0N0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
C9orf57Q5W0N0 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
C9orf57Q5W0N0 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
C9orf57Q5W0N0 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
C9orf57Q5W0N0 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
C9orf57Q5W0N0 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
C9orf57Q5W0N0 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
C9orf57Q5W0N0 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
C9orf57Q5W0N0 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
C9orf57Q5W0N0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
C9orf57Q5W0N0 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
C9orf57Q5W0N0 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
C9orf57Q5W0N0 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
C9orf57Q5W0N0 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
C9orf57Q5W0N0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
C9orf57Q5W0N0 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
C9orf57Q5W0N0 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
C9orf57Q5W0N0 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
C9orf57Q5W0N0 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
C9orf57Q5W0N0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
C9orf57Q5W0N0 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
C9orf57Q5W0N0 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
C9orf57Q5W0N0 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
C9orf57Q5W0N0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
C9orf57Q5W0N0 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms