Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWW1

C1QL3, Complement C1q-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QL3Q5VWW1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
C1QL3Q5VWW1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
C1QL3Q5VWW1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C1QL3Q5VWW1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
C1QL3Q5VWW1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C1QL3Q5VWW1 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
C1QL3Q5VWW1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C1QL3Q5VWW1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
C1QL3Q5VWW1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
C1QL3Q5VWW1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
C1QL3Q5VWW1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
C1QL3Q5VWW1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
C1QL3Q5VWW1 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
C1QL3Q5VWW1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
C1QL3Q5VWW1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
C1QL3Q5VWW1 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C1QL3Q5VWW1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C1QL3Q5VWW1 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C1QL3Q5VWW1 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C1QL3Q5VWW1 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C1QL3Q5VWW1 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C1QL3Q5VWW1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C1QL3Q5VWW1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C1QL3Q5VWW1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C1QL3Q5VWW1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C1QL3Q5VWW1 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
C1QL3Q5VWW1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C1QL3Q5VWW1 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
C1QL3Q5VWW1 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C1QL3Q5VWW1 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C1QL3Q5VWW1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C1QL3Q5VWW1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C1QL3Q5VWW1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C1QL3Q5VWW1 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C1QL3Q5VWW1 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C1QL3Q5VWW1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C1QL3Q5VWW1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C1QL3Q5VWW1 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C1QL3Q5VWW1 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C1QL3Q5VWW1 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C1QL3Q5VWW1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C1QL3Q5VWW1 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C1QL3Q5VWW1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C1QL3Q5VWW1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C1QL3Q5VWW1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C1QL3Q5VWW1 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C1QL3Q5VWW1 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C1QL3Q5VWW1 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
C1QL3Q5VWW1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C1QL3Q5VWW1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C1QL3Q5VWW1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
C1QL3Q5VWW1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C1QL3Q5VWW1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C1QL3Q5VWW1 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C1QL3Q5VWW1 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
C1QL3Q5VWW1 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
C1QL3Q5VWW1 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
C1QL3Q5VWW1 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
C1QL3Q5VWW1 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
C1QL3Q5VWW1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
C1QL3Q5VWW1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C1QL3Q5VWW1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C1QL3Q5VWW1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C1QL3Q5VWW1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C1QL3Q5VWW1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
C1QL3Q5VWW1 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C1QL3Q5VWW1 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
C1QL3Q5VWW1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
C1QL3Q5VWW1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C1QL3Q5VWW1 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C1QL3Q5VWW1 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C1QL3Q5VWW1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C1QL3Q5VWW1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C1QL3Q5VWW1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C1QL3Q5VWW1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C1QL3Q5VWW1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C1QL3Q5VWW1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C1QL3Q5VWW1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C1QL3Q5VWW1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C1QL3Q5VWW1 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C1QL3Q5VWW1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C1QL3Q5VWW1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C1QL3Q5VWW1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C1QL3Q5VWW1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C1QL3Q5VWW1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
C1QL3Q5VWW1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C1QL3Q5VWW1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C1QL3Q5VWW1 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
C1QL3Q5VWW1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C1QL3Q5VWW1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C1QL3Q5VWW1 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C1QL3Q5VWW1 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C1QL3Q5VWW1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C1QL3Q5VWW1 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
C1QL3Q5VWW1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
C1QL3Q5VWW1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C1QL3Q5VWW1 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
C1QL3Q5VWW1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
C1QL3Q5VWW1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
C1QL3Q5VWW1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms